244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A3016 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  99.48 
 
 
382 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  98.77 
 
 
487 aa  846    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  100 
 
 
484 aa  961    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  64.76 
 
 
450 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  64.97 
 
 
434 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  62.98 
 
 
430 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  62.98 
 
 
430 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  62.26 
 
 
430 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  61.56 
 
 
379 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  49.53 
 
 
434 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  47.42 
 
 
423 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  47.95 
 
 
428 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  51.72 
 
 
432 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  50.12 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  50.12 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  46.8 
 
 
429 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  46.8 
 
 
429 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  48.83 
 
 
430 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  48.8 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  48.8 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  47.09 
 
 
428 aa  339  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  45.86 
 
 
434 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  46.08 
 
 
435 aa  336  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  45.71 
 
 
435 aa  332  9e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  48.09 
 
 
423 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  47.93 
 
 
422 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  44.39 
 
 
435 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  44.8 
 
 
429 aa  309  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  42.65 
 
 
430 aa  305  9.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  43.67 
 
 
448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  44.12 
 
 
444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  42.58 
 
 
429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  41.5 
 
 
423 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  43.32 
 
 
433 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  42.38 
 
 
439 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  40.88 
 
 
432 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  47.41 
 
 
447 aa  289  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  45.34 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  37.92 
 
 
438 aa  282  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  43.1 
 
 
418 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  36.63 
 
 
420 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  38.26 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  38.13 
 
 
409 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  35.25 
 
 
433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  32.78 
 
 
432 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  27.54 
 
 
415 aa  156  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  29.7 
 
 
415 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  28.86 
 
 
418 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  28.89 
 
 
408 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  27.81 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  27.12 
 
 
432 aa  134  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  26.7 
 
 
452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  27.47 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  25.49 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  27.79 
 
 
419 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  24.78 
 
 
421 aa  99.4  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  24.38 
 
 
414 aa  99.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  27.59 
 
 
414 aa  97.1  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  25.06 
 
 
421 aa  95.1  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  27.09 
 
 
417 aa  94  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  26.6 
 
 
411 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  23.35 
 
 
425 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  29.62 
 
 
437 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  29.62 
 
 
437 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  29.62 
 
 
437 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.33 
 
 
439 aa  87.8  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  29.62 
 
 
437 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  29.62 
 
 
437 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  26.2 
 
 
441 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  29.74 
 
 
438 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  27.46 
 
 
448 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  22.74 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  25.92 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  26.2 
 
 
544 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  26.73 
 
 
425 aa  83.2  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.55 
 
 
432 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  29.84 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.23 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  28.57 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  28.57 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  28.57 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  31.7 
 
 
438 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  23.63 
 
 
404 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  24.43 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  29.41 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  23.88 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  26.3 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  23.49 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  23.19 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  23.96 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  25.38 
 
 
447 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  24.72 
 
 
547 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  28.42 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  25.45 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  26.86 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  26.86 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  24.49 
 
 
547 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  24.49 
 
 
547 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  22.64 
 
 
434 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>