46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2963 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  100 
 
 
722 aa  357  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  100 
 
 
168 aa  341  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  100 
 
 
180 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  91.67 
 
 
180 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  73.21 
 
 
177 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  72.62 
 
 
177 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  71.26 
 
 
177 aa  259  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  71.26 
 
 
177 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  71.26 
 
 
177 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  70.66 
 
 
177 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  53.61 
 
 
176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  41.07 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  40.34 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  40.91 
 
 
185 aa  94  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  38.85 
 
 
163 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  33.33 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  47.46 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  45.59 
 
 
143 aa  51.6  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  44.23 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  36.03 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  42.42 
 
 
157 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  35.56 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  36.05 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  31.4 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  53.49 
 
 
140 aa  44.3  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  37.5 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4400  TadE family protein  36.26 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  45.45 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  46.81 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  44.68 
 
 
126 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  46.81 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  40.91 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  38.64 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  40.91 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  24.39 
 
 
176 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  43.18 
 
 
135 aa  42  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  47.73 
 
 
152 aa  42  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  38.64 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  47.27 
 
 
124 aa  41.2  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  30.86 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  47.73 
 
 
147 aa  41.2  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  45.45 
 
 
140 aa  40.8  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  38.64 
 
 
147 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  47.92 
 
 
134 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  38.64 
 
 
147 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  38.64 
 
 
147 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>