More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2112 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2199  FMN-dependent family dehydrogenase  99.32 
 
 		 441 aa  876    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1565  FMN-dependent family dehydrogenase  100 
 
 		 407 aa  810    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0604  putative L(+)-mandelate dehydrogenase  99.55 
 
 		 441 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0813  FMN-dependent family dehydrogenase  92.65 
 
 		 407 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2038  FMN-dependent family dehydrogenase  99.55 
 
 		 441 aa  880    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2112  FMN-dependent family dehydrogenase  100 
 
 		 447 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0717  FMN-dependent family dehydrogenase  99.55 
 
 		 447 aa  891    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1696  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  80.36 
 
 		 405 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0789  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  75.26 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5798  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  67.73 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1661  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  67.03 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  62.22 
 
 		 411 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7084  dehydrogenase  60.26 
 
 		 392 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1708  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.59 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  0.602463 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4469  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  56.69 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0508385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3410  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.03 
 
 		 435 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194367  hitchhiker  0.0000661899 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0228  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  51.09 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2428  putative L-lactate dehydrogenase  46.46 
 
 		 396 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.51 
 
 		 412 aa  298  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  41.82 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5475  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.32 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1020  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  45.14 
 
 		 372 aa  263  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168014  normal  0.586617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.5 
 
 		 415 aa  253  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  40.05 
 
 		 394 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3174  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.16 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.898854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  36.39 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.34 
 
 		 357 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6402  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.42 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  35.68 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  35.68 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.97 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.99 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.15 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.76 
 
 		 390 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.92 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.56 
 
 		 379 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  38.22 
 
 		 379 aa  236  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.13 
 
 		 378 aa  236  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  39.42 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.44 
 
 		 380 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1403  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.11 
 
 		 368 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00336342 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  36.09 
 
 		 386 aa  230  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0280  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.9 
 
 		 410 aa  230  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  37.83 
 
 		 386 aa  230  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  37.3 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1846  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.13 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.83 
 
 		 381 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2407  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.58 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463668  normal  0.0231198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3045  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.6 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.04 
 
 		 383 aa  226  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  37.23 
 
 		 379 aa  226  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.94 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0668  (S)-mandelate dehydrogenase  42.01 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.94 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  35.62 
 
 		 383 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  33.94 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.77 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11900  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD2  36.63 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.877385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.97 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  37.01 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  35.09 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.22 
 
 		 379 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  37.77 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  37.77 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  37.77 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.83 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.16 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.88 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4230  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.83 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  36.75 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  36.84 
 
 		 396 aa  220  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.18 
 
 		 379 aa  220  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  36.84 
 
 		 396 aa  220  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  36.84 
 
 		 396 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.84 
 
 		 396 aa  220  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  36.84 
 
 		 396 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  36.84 
 
 		 396 aa  220  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.84 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  36.84 
 
 		 396 aa  220  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  36.84 
 
 		 396 aa  220  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.4 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.47 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.04 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.19 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5297  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.2 
 
 		 422 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.7 
 
 		 379 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  31.84 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.87 
 
 		 397 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4877  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.73 
 
 		 379 aa  219  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.414226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2488  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.12 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0763521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.86 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.51 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  37.73 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.54 
 
 		 390 aa  217  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  35.54 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63090  L-lactate dehydrogenase  37.93 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0242094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  37.67 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4737  L-lactate dehydrogenase  37.47 
 
 		 381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.59 
 
 		 385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>