More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1696 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  678    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  70.96 
 
 
338 aa  491  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  71.17 
 
 
336 aa  489  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  69.37 
 
 
336 aa  464  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  53.73 
 
 
337 aa  354  1e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  40.73 
 
 
336 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.44 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.31 
 
 
329 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.46 
 
 
335 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.26 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.76 
 
 
336 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.31 
 
 
339 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.67 
 
 
336 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
340 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.09 
 
 
338 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 
344 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.87 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
336 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.39 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.4 
 
 
340 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.31 
 
 
336 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
327 aa  175  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  32.46 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  30.89 
 
 
352 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
373 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.59 
 
 
341 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.65 
 
 
346 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
373 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  30.61 
 
 
349 aa  166  5e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
337 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.75 
 
 
373 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
373 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
373 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
330 aa  165  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.18 
 
 
373 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  31.59 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  33.33 
 
 
359 aa  161  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.49 
 
 
349 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  31.3 
 
 
341 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  31.3 
 
 
341 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
347 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.34 
 
 
341 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.03 
 
 
351 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  31.3 
 
 
341 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  31.01 
 
 
341 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31 
 
 
347 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  31.01 
 
 
340 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  30.79 
 
 
348 aa  159  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  31.79 
 
 
340 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  31.79 
 
 
340 aa  159  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
373 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
318 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  30.72 
 
 
341 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  30.3 
 
 
361 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  30.72 
 
 
341 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  31.1 
 
 
342 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  29.53 
 
 
345 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 
341 aa  156  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  155  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.94 
 
 
342 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  31.72 
 
 
341 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 
341 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
350 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  32.3 
 
 
338 aa  155  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 
341 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  30.72 
 
 
341 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 
341 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 
341 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 
341 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  29.86 
 
 
345 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 
341 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 
341 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  30.14 
 
 
341 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 
341 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  31.2 
 
 
343 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  29.68 
 
 
343 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
349 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  29.57 
 
 
345 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.79 
 
 
348 aa  152  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
347 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  29.57 
 
 
341 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
347 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  29.86 
 
 
341 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  29.86 
 
 
341 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  29.86 
 
 
343 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>