More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0565 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 		 546 aa  1122    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  52.76 
 
 		 546 aa  567  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  49.81 
 
 		 542 aa  526  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  44.82 
 
 		 552 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  46.27 
 
 		 585 aa  450  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  43.61 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  42.78 
 
 		 547 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  42.19 
 
 		 543 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  40.38 
 
 		 561 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  41.39 
 
 		 586 aa  395  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  37.92 
 
 		 541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  37.45 
 
 		 522 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  38.03 
 
 		 560 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  47.13 
 
 		 537 aa  326  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  36.54 
 
 		 554 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  36.2 
 
 		 552 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  35.5 
 
 		 534 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  35.81 
 
 		 533 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  33.71 
 
 		 537 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  32.95 
 
 		 543 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  32.84 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 543 aa  264  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  31.85 
 
 		 543 aa  262  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  33.07 
 
 		 541 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 543 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  33 
 
 		 536 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  32.57 
 
 		 527 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  29.42 
 
 		 528 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.05 
 
 		 536 aa  170  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 536 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.87 
 
 		 536 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.68 
 
 		 536 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.64 
 
 		 536 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.64 
 
 		 536 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.64 
 
 		 536 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.68 
 
 		 536 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 531 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 590 aa  147  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 		 532 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.19 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.58 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.93 
 
 		 544 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 544 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.23 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 		 622 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1954  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.24 
 
 		 542 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0666582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 		 530 aa  137  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1983  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.04 
 
 		 542 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.776942  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 552 aa  136  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  25.19 
 
 		 530 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  23.8 
 
 		 531 aa  134  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  27.03 
 
 		 520 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  24.34 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1683  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, oppA-like  24.6 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1709  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  24.33 
 
 		 542 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 		 545 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 529 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  26.01 
 
 		 558 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0214  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.55 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.88 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0195  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.55 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0182  solute-binding family 5 protein  24.55 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1905  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.79 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0194  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.55 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5107  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.37 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 		 531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0219  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.55 
 
 		 546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0185  solute-binding family 5 protein  24.37 
 
 		 546 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.24 
 
 		 543 aa  128  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1461  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 542 aa  127  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0157801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 545 aa  127  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  24.37 
 
 		 546 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.75 
 
 		 535 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  23.54 
 
 		 552 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  23.54 
 
 		 552 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1732  oligopeptide ABC transporter solute binding protein  24.25 
 
 		 519 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 		 530 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.51 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 538 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0179  4-phytase  24.01 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3475  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.19 
 
 		 542 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 594 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1726  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 542 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00443196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0236  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.19 
 
 		 546 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1867  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.61 
 
 		 542 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.37 
 
 		 525 aa  123  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  26.64 
 
 		 554 aa  123  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  24.95 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3695  oligopeptide-binding protein OppA  24.69 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00658046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>