More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0455 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
193 aa  376  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0834  putative adenine phosphoribosyltransferase  59.07 
 
 
193 aa  219  3e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  55.48 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
184 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
174 aa  165  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
172 aa  160  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  49.37 
 
 
424 aa  158  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
178 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
175 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
178 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
171 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
177 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1005  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
182 aa  154  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  49.37 
 
 
181 aa  154  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 
177 aa  154  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
178 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0887  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
182 aa  154  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
172 aa  154  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0934  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
182 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
179 aa  153  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
168 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
173 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
172 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
172 aa  152  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
172 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  47.43 
 
 
187 aa  151  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
179 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
175 aa  151  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
170 aa  150  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
182 aa  150  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
172 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29461  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
182 aa  150  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.268301  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 
171 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
170 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
187 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
175 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
187 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
179 aa  148  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
170 aa  147  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 
171 aa  147  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  147  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
180 aa  147  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1364  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
178 aa  147  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.647458  normal  0.747385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  48.77 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  45.51 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
181 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
181 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
181 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
176 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
188 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0435  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
170 aa  145  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 
170 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
181 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
181 aa  144  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  43.53 
 
 
173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
183 aa  144  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
183 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
181 aa  144  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
175 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  47.92 
 
 
185 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0680  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
179 aa  143  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 
185 aa  143  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
172 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  44.69 
 
 
185 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 
171 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
188 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
188 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
173 aa  143  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
171 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 
194 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
181 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
181 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
174 aa  142  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
177 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  44.07 
 
 
196 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
184 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
179 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
181 aa  141  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
184 aa  141  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
172 aa  141  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
177 aa  141  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  45.28 
 
 
181 aa  140  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>