More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0309 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0309  transposase  100 
 
 		 93 aa  197  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00658736  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03250  transposase  68.13 
 
 		 286 aa  136  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0405  Integrase catalytic region  64.52 
 
 		 272 aa  135  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0876667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15050  transposase  65.59 
 
 		 285 aa  135  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.316809  normal  0.91579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05860  transposase  65.59 
 
 		 283 aa  135  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1125  Integrase catalytic region  65.59 
 
 		 284 aa  135  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0947963  hitchhiker  0.00000135034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2913  Integrase catalytic region  65.59 
 
 		 284 aa  135  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14520  transposase  65.59 
 
 		 283 aa  133  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01660  transposase  65.59 
 
 		 285 aa  132  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04830  transposase  64.52 
 
 		 283 aa  132  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0367242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 		 268 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 		 268 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 		 268 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 		 268 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  44.94 
 
 		 259 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  44.94 
 
 		 259 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  44.94 
 
 		 259 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  44.94 
 
 		 259 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1165  integrase catalytic region  45.65 
 
 		 222 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  45.65 
 
 		 278 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  45.65 
 
 		 278 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  45.65 
 
 		 278 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  45.65 
 
 		 278 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  44.94 
 
 		 259 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 		 278 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 		 260 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 		 278 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 		 278 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 		 278 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  43.48 
 
 		 278 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  43.48 
 
 		 269 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  43.48 
 
 		 278 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  43.48 
 
 		 278 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  44.57 
 
 		 215 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  44.57 
 
 		 270 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  44.57 
 
 		 270 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  44.57 
 
 		 270 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  45.65 
 
 		 267 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  45.65 
 
 		 267 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  45.65 
 
 		 249 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  45.65 
 
 		 249 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4172  integrase core subunit  43.68 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0908  integrase core subunit  43.68 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0196  integrase core subunit  43.68 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3122  integrase core subunit  43.68 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00391606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3998  integrase core subunit  43.68 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3759  integrase core subunit  43.68 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3902  integrase core subunit  43.68 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3804  integrase core subunit  43.68 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  42.39 
 
 		 277 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  42.39 
 
 		 277 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  42.39 
 
 		 277 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  43.48 
 
 		 278 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  43.82 
 
 		 283 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  43.82 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  43.82 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  43.82 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  43.82 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  43.82 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  43.82 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  43.82 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  43.82 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  43.82 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  43.82 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  41.76 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  41.76 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  42.7 
 
 		 283 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  41.3 
 
 		 248 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  41.3 
 
 		 248 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  41.3 
 
 		 248 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  41.3 
 
 		 248 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  41.3 
 
 		 248 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  41.3 
 
 		 248 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  41.3 
 
 		 248 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  41.3 
 
 		 248 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0018  transposase  41.94 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3343  transposase  45.98 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  44.83 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  41.38 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  41.38 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3594  transposase, IS3 family  45.98 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  40.22 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  44.83 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  44.83 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  40.22 
 
 		 279 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  40.22 
 
 		 279 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  40.22 
 
 		 279 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  40.22 
 
 		 279 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  40.23 
 
 		 278 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  40.86 
 
 		 278 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  39.78 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  39.78 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4086  transposase, C-terminal region  50 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0101  transposase  39.78 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  40 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  40 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>