More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14520 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14520  transposase  100 
 
 		 283 aa  600  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04830  transposase  95.76 
 
 		 283 aa  571  1.0000000000000001e-162  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0367242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05860  transposase  91.87 
 
 		 283 aa  559  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2913  Integrase catalytic region  73.57 
 
 		 284 aa  450  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1125  Integrase catalytic region  73.57 
 
 		 284 aa  450  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0947963  hitchhiker  0.00000135034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03250  transposase  72.28 
 
 		 286 aa  444  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15050  transposase  72.54 
 
 		 285 aa  442  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.316809  normal  0.91579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01660  transposase  71.83 
 
 		 285 aa  435  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0405  Integrase catalytic region  73.41 
 
 		 272 aa  422  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0876667  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  41.9 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  41.9 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  41.9 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  41.9 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  40.28 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  40.28 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  40.28 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  40.28 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  40.28 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  40.28 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  40.28 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  40.28 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  40.28 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  40.28 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  40.28 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  40.64 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  40.64 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  39.93 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  40.28 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  40.15 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  39.34 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  39.34 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  38.16 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  38.16 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  40.65 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  40.65 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  36.79 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  36.79 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  38.38 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  38.38 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  36.76 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  36.76 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  36.76 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  39.29 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  38.01 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  38.01 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  36.04 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  36.04 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  36.04 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  36.04 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  37.63 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  37.36 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  37.36 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  37.36 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  37.36 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  36.23 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  37.36 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  36.04 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  36.84 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  36.84 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  36.84 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  34.32 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  34.19 
 
 		 269 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  37.23 
 
 		 512 aa  171  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  37.23 
 
 		 512 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  34.32 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  36.84 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  35.61 
 
 		 505 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  35.61 
 
 		 505 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  36.63 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  36.63 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  36.63 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  36.63 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0196  integrase core subunit  35.88 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  35.86 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3804  integrase core subunit  35.88 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3122  integrase core subunit  35.88 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00391606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0908  integrase core subunit  35.88 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3998  integrase core subunit  35.88 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3902  integrase core subunit  35.88 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4172  integrase core subunit  35.88 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3759  integrase core subunit  35.88 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  37.79 
 
 		 215 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  36.04 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  36.04 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  36.04 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  36.04 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  34.64 
 
 		 510 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  34.3 
 
 		 512 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  36.82 
 
 		 512 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  35.09 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  35.23 
 
 		 385 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  36.33 
 
 		 512 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  35.02 
 
 		 515 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>