More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0298 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7084  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.25 
 
 		 690 aa  726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3307  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.89 
 
 		 701 aa  792    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1534  DNA topoisomerase IV subunit B  53.96 
 
 		 693 aa  768    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300498  normal  0.0102248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15990  DNA topoisomerase IV subunit B  56.84 
 
 		 710 aa  833    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.440467  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15910  DNA topoisomerase IV subunit B  58.2 
 
 		 709 aa  877    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.39843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14380  DNA topoisomerase IV subunit B  54.82 
 
 		 705 aa  804    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0298  DNA topoisomerase plasmid partition protein B  100 
 
 		 758 aa  1562    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1922  DNA topoisomerase IV subunit B  54.49 
 
 		 708 aa  787    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  0.0348119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1611  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.71 
 
 		 696 aa  746    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00143665  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0693  DNA gyrase, B subunit, C-terminal domain protein  78.3 
 
 		 792 aa  1257    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1763  DNA topoisomerase IV subunit B  53.64 
 
 		 709 aa  744    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1988  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  57.52 
 
 		 715 aa  871    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2055  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  58.06 
 
 		 713 aa  852    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1425  DNA topoisomerase IV subunit B  57.76 
 
 		 723 aa  863    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1619  DNA topoisomerase IV subunit B  56.32 
 
 		 702 aa  827    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0681707  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13260  DNA topoisomerase IV subunit B  55.58 
 
 		 701 aa  818    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0630779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1613  DNA topoisomerase IV subunit B  56.3 
 
 		 702 aa  833    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000263124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2958  DNA topoisomerase IV subunit B  51.92 
 
 		 710 aa  755    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2394  DNA topoisomerase  51.39 
 
 		 690 aa  720    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367142  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1674  DNA gyrase subunit B  45.32 
 
 		 730 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.759972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1680  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  44.8 
 
 		 702 aa  615  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.313615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08220  DNA topoisomerase IV subunit B  43.97 
 
 		 701 aa  595  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2280  DNA gyrase subunit B domain protein  43.37 
 
 		 680 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.557074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  40.61 
 
 		 649 aa  532  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  40.81 
 
 		 632 aa  529  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  41.62 
 
 		 714 aa  525  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  40.99 
 
 		 686 aa  525  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  40.69 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  42.03 
 
 		 644 aa  523  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  39.92 
 
 		 648 aa  525  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  41.54 
 
 		 661 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  39.66 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  41.51 
 
 		 648 aa  517  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00060  DNA gyrase subunit B  41.66 
 
 		 683 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  40.77 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  40.53 
 
 		 685 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  40.51 
 
 		 675 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  40.67 
 
 		 675 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  41.49 
 
 		 640 aa  512  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  41.04 
 
 		 695 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  40.21 
 
 		 665 aa  510  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  40.67 
 
 		 675 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  40.67 
 
 		 675 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0009  DNA gyrase, B subunit  41.37 
 
 		 688 aa  509  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00060  DNA gyrase subunit B  43.12 
 
 		 701 aa  507  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  41.41 
 
 		 696 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2134  DNA topoisomerase IV subunit B  54 
 
 		 702 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  40.48 
 
 		 643 aa  503  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  40.37 
 
 		 657 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  41.52 
 
 		 720 aa  502  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0006  DNA gyrase, B subunit  41.26 
 
 		 681 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  40.13 
 
 		 675 aa  502  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  40.56 
 
 		 670 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  41.07 
 
 		 635 aa  497  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  41.04 
 
 		 637 aa  498  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  41.43 
 
 		 645 aa  498  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  41.15 
 
 		 648 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0010  DNA gyrase, B subunit  40.11 
 
 		 680 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  39.63 
 
 		 654 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  39.21 
 
 		 660 aa  490  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  40.86 
 
 		 672 aa  492  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  39.28 
 
 		 638 aa  487  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  38.37 
 
 		 650 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  41.17 
 
 		 649 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  37.22 
 
 		 655 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  39.41 
 
 		 644 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  38.74 
 
 		 652 aa  487  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  41.84 
 
 		 666 aa  487  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  41.62 
 
 		 647 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  40.13 
 
 		 719 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  39.26 
 
 		 642 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  37.15 
 
 		 655 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  40.43 
 
 		 686 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  37.29 
 
 		 655 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  39.07 
 
 		 656 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  38.49 
 
 		 655 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  37.81 
 
 		 655 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  37.62 
 
 		 655 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  37.62 
 
 		 655 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  37.88 
 
 		 655 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf020  topoiosmerase IV subunit B  40.62 
 
 		 637 aa  478  1e-133  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  39.33 
 
 		 644 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  40.61 
 
 		 685 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  39.65 
 
 		 645 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  40.51 
 
 		 642 aa  475  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  37.47 
 
 		 655 aa  475  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0006  DNA gyrase, B subunit  40.64 
 
 		 698 aa  468  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00100  DNA gyrase subunit B  40.03 
 
 		 711 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  37.82 
 
 		 654 aa  464  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  38.64 
 
 		 653 aa  463  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  40.48 
 
 		 661 aa  465  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  40.78 
 
 		 711 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  38.1 
 
 		 645 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  40.27 
 
 		 647 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  36.45 
 
 		 652 aa  459  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  37.48 
 
 		 651 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  37.3 
 
 		 645 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  39.25 
 
 		 649 aa  455  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  38.72 
 
 		 644 aa  452  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1427  DNA topoisomerase IV subunit B  53.59 
 
 		 703 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>