52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A5380 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A5380  response regulator, LytTR family  100 
 
 		 149 aa  306  8e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4893  response regulator  99.33 
 
 		 149 aa  303  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2811  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1684  response regulator  41.1 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000929378  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0405  response regulator  36.3 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.84109  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16700  response regulator of the LytR/AlgR family  33.79 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.442012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0703  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  28.08 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2433  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2387  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22920  response regulator of the LytR/AlgR family  25.68 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  24.66 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1260  response regulator receiver protein  28 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B4  response regulator  30.28 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.283822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0937  response regulator  27.03 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122555  normal  0.418012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2448  LytTr DNA-binding region  26.36 
 
 		 478 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269768  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1010  LytTr DNA-binding domain protein  23.81 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0070  response regulator  27.78 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000561493  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  26.8 
 
 		 244 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1420  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0724  response regulator  25.9 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.432871  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  26.61 
 
 		 276 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.09 
 
 		 238 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.43 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  21.43 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  24.55 
 
 		 246 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  25.64 
 
 		 246 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3000  response regulator receiver domain-containing protein  29.47 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  28.42 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  25.64 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  25.64 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  25.64 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  25.64 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 245 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  25.64 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  29.79 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  28.42 
 
 		 246 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0979  response regulator  30.67 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  29.47 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  29.59 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.9 
 
 		 246 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1413  response regulator  24.49 
 
 		 176 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00405485  hitchhiker  1.97823e-19 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  25.76 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 242 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  26.09 
 
 		 246 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  25.76 
 
 		 238 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 247 aa  40.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0733  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.25 
 
 		 243 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.05 
 
 		 240 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 250 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.02 
 
 		 253 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  24.78 
 
 		 243 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>