51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2387 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2387  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  295  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2433  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  295  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2811  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0070  response regulator  33.06 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000561493  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0937  response regulator  29.45 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122555  normal  0.418012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5380  response regulator, LytTR family  28.57 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  32.84 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4893  response regulator  27.89 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1401  response regulator receiver protein  28.77 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0405  response regulator  30.67 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.84109  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B4  response regulator  27.21 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.283822  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1684  response regulator  28.97 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000929378  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1413  response regulator  28.08 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00405485  hitchhiker  1.97823e-19 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22920  response regulator of the LytR/AlgR family  25.9 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0703  response regulator receiver protein  22.73 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  32.11 
 
 
252 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  25.85 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  41.89 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1318  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.18 
 
 
238 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16700  response regulator of the LytR/AlgR family  26.62 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.442012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  31.58 
 
 
248 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0724  response regulator  22.15 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.432871  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1010  LytTr DNA-binding domain protein  29.06 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2035  response regulator receiver protein  29.87 
 
 
282 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.150352  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  29.91 
 
 
246 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  28.97 
 
 
246 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  28.97 
 
 
246 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  28.97 
 
 
246 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  28.97 
 
 
246 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  27.35 
 
 
246 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.59 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  29.91 
 
 
246 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  28.97 
 
 
246 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  29.91 
 
 
246 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  30.53 
 
 
248 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0207  LytTR family two component transcriptional regulator  31.58 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
247 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  28.97 
 
 
246 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0210  LytTR family two component transcriptional regulator  30.53 
 
 
247 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375452  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4386  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.93 
 
 
260 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0979  response regulator  31.25 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.57 
 
 
239 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.57 
 
 
239 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.57 
 
 
239 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.57 
 
 
239 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.57 
 
 
239 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.91 
 
 
238 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.91 
 
 
238 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  28.71 
 
 
246 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0185  LytTR family two component transcriptional regulator  30.53 
 
 
247 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.91 
 
 
238 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>