39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0979 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0979  response regulator  100 
 
 		 108 aa  215  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1420  response regulator receiver protein  70.09 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0724  response regulator  42.86 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.432871  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0417  response regulator  38.46 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22920  response regulator of the LytR/AlgR family  30.85 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  30.61 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  31.13 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1010  LytTr DNA-binding domain protein  29.59 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  29.81 
 
 		 244 aa  51.6  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1413  response regulator  30.85 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00405485  hitchhiker  1.97823e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0703  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  29.9 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0532  response regulator  29.67 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  31.19 
 
 		 238 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  31.19 
 
 		 238 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0183  response regulator  26.55 
 
 		 246 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  31.19 
 
 		 238 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  31.19 
 
 		 238 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  31.19 
 
 		 238 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  25.89 
 
 		 246 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1260  response regulator receiver protein  27.85 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  31.19 
 
 		 238 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  31.19 
 
 		 238 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  31.19 
 
 		 238 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  31.19 
 
 		 238 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1401  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 238 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  30.28 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  31.18 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4893  response regulator  30.67 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5380  response regulator, LytTR family  30.67 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  26.85 
 
 		 252 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2387  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16700  response regulator of the LytR/AlgR family  30.67 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.442012 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2433  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  27.45 
 
 		 255 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  23.36 
 
 		 553 aa  40  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  25.25 
 
 		 276 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>