24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0405 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0405  response regulator  100 
 
 		 155 aa  320  5e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.84109  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1684  response regulator  45.33 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000929378  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4893  response regulator  36.3 
 
 		 149 aa  90.5  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5380  response regulator, LytTR family  36.3 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2811  response regulator receiver protein  34.67 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2433  hypothetical protein  30.67 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2387  hypothetical protein  30.67 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16700  response regulator of the LytR/AlgR family  25.52 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.442012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0703  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22920  response regulator of the LytR/AlgR family  23.97 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  26.71 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1413  response regulator  26.85 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00405485  hitchhiker  1.97823e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  26.47 
 
 		 249 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0070  response regulator  26.6 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000561493  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  29.47 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.43 
 
 		 241 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3096  response regulator receiver protein  23.73 
 
 		 247 aa  44.3  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1010  LytTr DNA-binding domain protein  23.95 
 
 		 169 aa  44.3  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0991  LytTR family two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  29.03 
 
 		 264 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3314  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2666  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.71 
 
 		 250 aa  40.8  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4282  LytTR family two component transcriptional regulator  32.35 
 
 		 232 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.442781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>