47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0024 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  51.85 
 
 		 302 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  45.58 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  32.78 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  30.22 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  25.37 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  31.54 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  35.9 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  26.96 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  25.23 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  25.23 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  25.23 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  25.81 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  26.67 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  26.67 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  30.84 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  31.93 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.26 
 
 		 182 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  28 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  26.91 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  32.43 
 
 		 170 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  25.82 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  30.07 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  27.21 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  24.57 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  32 
 
 		 175 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  29.73 
 
 		 435 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  29.73 
 
 		 435 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  32.59 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  34.91 
 
 		 177 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  34.86 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  23.32 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  26.83 
 
 		 171 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  35.88 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  32.17 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  32.2 
 
 		 173 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  28.87 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  32.94 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  32.94 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0915  hypothetical protein  29.41 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.938831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  33.62 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  29.1 
 
 		 246 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  28.83 
 
 		 160 aa  42.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  27.13 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  27.86 
 
 		 188 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>