31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7023 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  61.88 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  61.58 
 
 		 204 aa  221  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  54.95 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  57.95 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  49.47 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  52.58 
 
 		 208 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  40.7 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  32.95 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  28.96 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  32.32 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  32.43 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  29.65 
 
 		 229 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  28.32 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  27.46 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  31.14 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  29.05 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  32.42 
 
 		 198 aa  72  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  27.22 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  26.44 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  25.75 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  28.48 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  33.12 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  25.58 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  34.07 
 
 		 277 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  27.39 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  26.11 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2054  hypothetical protein  25.99 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0401  hypothetical protein  25.99 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.816524  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  31.97 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>