34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5216 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  58.92 
 
 		 185 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  59.14 
 
 		 186 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  56.99 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  52.72 
 
 		 184 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  61.08 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  48.92 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  30.23 
 
 		 216 aa  91.3  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  31.33 
 
 		 205 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  28.17 
 
 		 200 aa  84.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  39.81 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  39.81 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  39.81 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  33.61 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  29.87 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  40.38 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  42.68 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  44.59 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  31.36 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  27.44 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  28.28 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  29.79 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2097  hypothetical protein  28.89 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168181  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  29.08 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  24.49 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1725  hypothetical protein  29.76 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  28.33 
 
 		 252 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  25.33 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  27.2 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  27.43 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  26.4 
 
 		 166 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1565  hypothetical protein  29 
 
 		 223 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.333128  normal  0.716752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  31.75 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6079  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>