46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3957 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  65.13 
 
 		 1244 aa  1541    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  100 
 
 		 1232 aa  2455    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  65.29 
 
 		 1255 aa  1567    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  66.15 
 
 		 1243 aa  1562    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  64.88 
 
 		 1237 aa  1593    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  62.68 
 
 		 1240 aa  1490    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  63.97 
 
 		 1210 aa  1453    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  34.61 
 
 		 1177 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1240 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1197 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1192 aa  383  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1141 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1149 aa  354  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1151 aa  348  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1175 aa  333  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1149 aa  331  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1132 aa  252  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1146 aa  232  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1132 aa  230  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1146 aa  230  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1111 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1133 aa  226  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1128 aa  221  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1141 aa  218  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1169 aa  194  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  25 
 
 		 1155 aa  163  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1088 aa  160  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1094 aa  159  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1094 aa  155  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1102 aa  103  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1105 aa  103  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1097 aa  97.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1162 aa  93.2  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  20.65 
 
 		 996 aa  91.7  9e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  30.43 
 
 		 995 aa  87.8  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1024 aa  80.9  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  19.85 
 
 		 1093 aa  76.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  22.83 
 
 		 943 aa  67  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1040 aa  66.2  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  28.7 
 
 		 1079 aa  58.5  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  25.66 
 
 		 1144 aa  58.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1102 aa  50.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1080 aa  49.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  28.12 
 
 		 1224 aa  48.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  24.37 
 
 		 1094 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  23.48 
 
 		 1061 aa  46.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>