75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2206 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  872    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  29.87 
 
 
441 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  25.85 
 
 
658 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  29.76 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.34 
 
 
447 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
968 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  26.54 
 
 
523 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
525 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
493 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  24.69 
 
 
469 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
516 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
493 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  27.95 
 
 
507 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
493 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  25.73 
 
 
511 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  28.9 
 
 
508 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  24.36 
 
 
566 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  22.99 
 
 
553 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  24.42 
 
 
469 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  23.54 
 
 
492 aa  84  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  25.94 
 
 
466 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
487 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  27.27 
 
 
584 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
567 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  24.51 
 
 
538 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
493 aa  79.7  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
586 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  25.82 
 
 
537 aa  78.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  25.68 
 
 
522 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
534 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  25.89 
 
 
528 aa  76.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  24.65 
 
 
539 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  30.3 
 
 
563 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  23.74 
 
 
541 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  26.47 
 
 
547 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  23.89 
 
 
572 aa  73.9  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
528 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
579 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
539 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  27.95 
 
 
592 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  26.97 
 
 
555 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  26.65 
 
 
531 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
560 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  24 
 
 
534 aa  63.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  22.93 
 
 
573 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  28.98 
 
 
559 aa  59.7  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  24.56 
 
 
520 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
541 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
414 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1445  glycosyl transferase family 39  36.36 
 
 
599 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  29.73 
 
 
585 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  28.49 
 
 
372 aa  50.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0600  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
387 aa  50.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  27.17 
 
 
512 aa  49.7  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  31.08 
 
 
323 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0678  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
918 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57202  predicted protein  26 
 
 
739 aa  46.6  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0669356  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  27 
 
 
565 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
574 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  28.24 
 
 
574 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  32 
 
 
549 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1040  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
448 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000509262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
553 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
574 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90238  predicted protein  28 
 
 
821 aa  44.3  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  28.48 
 
 
534 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
554 aa  44.3  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  25.29 
 
 
918 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
569 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0114  hypothetical protein  30.95 
 
 
587 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.112922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  26.74 
 
 
541 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2183  family 39 glycosyl transferase  37.33 
 
 
536 aa  43.1  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>