More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0717 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 337 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.83 
 
 		 337 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  86.94 
 
 		 337 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.49 
 
 		 337 aa  521  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.678107  normal  0.316578 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2419  ABC transporter D-Ala-D-Ala-binding inner membrane protein  56.5 
 
 		 341 aa  408  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.279427  hitchhiker  0.0000166625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2114  oligopeptide ABC transporter membrane protein  56.4 
 
 		 343 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.18 
 
 		 338 aa  298  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  44.48 
 
 		 336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  42.99 
 
 		 336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  45.07 
 
 		 336 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  44.48 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.39 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.51 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  44.78 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.01 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  42.99 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.62 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  43.11 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.51 
 
 		 336 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  42.99 
 
 		 336 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  42.99 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  43.58 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  44.51 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.69 
 
 		 335 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 		 335 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  44.28 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.92 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  43.92 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  43.92 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  43.92 
 
 		 336 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  43.92 
 
 		 336 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  42.56 
 
 		 337 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  42.31 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  42.31 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  43.4 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.62 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.09 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  41.19 
 
 		 336 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 		 346 aa  271  9e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  41.49 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  41.76 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  42.01 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  42.01 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  42.01 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  42.01 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  43.58 
 
 		 336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.56 
 
 		 352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.32 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.32 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  43.62 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  41.54 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  43.28 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  41.54 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  41.42 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.19 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  41.79 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.32 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.32 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  41.84 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  41.12 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  41.12 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  41.12 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.19 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.9 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 		 352 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0522734  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  40.95 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12510  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  44.54 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0113626  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  40.95 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  43.75 
 
 		 334 aa  260  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.23 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.716973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01444  D-ala-D-ala transporter subunit  45.02 
 
 		 340 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.982069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 		 340 aa  258  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0198405  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2098  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  45.02 
 
 		 340 aa  258  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 		 340 aa  258  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01456  hypothetical protein  45.02 
 
 		 340 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1675  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  45.02 
 
 		 340 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.925292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 		 365 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>