More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0490 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  48.78 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  47.85 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  49.38 
 
 		 161 aa  153  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  48.15 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  45.12 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  46.95 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  42.5 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  42.68 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  41.25 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  44.44 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  47.56 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  43.29 
 
 		 156 aa  135  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  47.24 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  42.42 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  42.42 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  41.72 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  41.46 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  44.38 
 
 		 155 aa  121  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  43.21 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  44.44 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  42.33 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  41.1 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  37.66 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  42.33 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  42.59 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  36.53 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  40.12 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  41.46 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  41.98 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  41.07 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  38.51 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  39.51 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  41.1 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  41.1 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  37.27 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  41.1 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  36.36 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  37.2 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  42.06 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  37.72 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  38.51 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  36.97 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  37.72 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  37.27 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  40.24 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  35.15 
 
 		 148 aa  97.8  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  35.76 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  35.76 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  35.76 
 
 		 154 aa  97.1  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  32.76 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  42.97 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  39.88 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  37.42 
 
 		 168 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  37.42 
 
 		 168 aa  94.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4551  SecC-like protein  42.19 
 
 		 131 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  33.54 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  37.42 
 
 		 168 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  39.69 
 
 		 126 aa  94  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  37.42 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  35.33 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  36.81 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  35.58 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  42.75 
 
 		 129 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  40.77 
 
 		 128 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  40.77 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  33.54 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  38.04 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  44 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  87.8  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  41.35 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  40.77 
 
 		 132 aa  86.3  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  37.6 
 
 		 137 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  44 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  42.25 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  41.3 
 
 		 148 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4258  hypothetical protein  39.42 
 
 		 149 aa  84  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  31.9 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  43.41 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  42.06 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  39.53 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  32.52 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  39.85 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0175  hypothetical protein  38.57 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  44.88 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0415  hypothetical protein  44.44 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0098  hypothetical protein  44.44 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0577  hypothetical protein  44.44 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2275  hypothetical protein  44.44 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2012  hypothetical protein  44.44 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3083  hypothetical protein  44.44 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.457185  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  32.93 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0458  hypothetical protein  38.69 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  36.2 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>