47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18420 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_18420  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  220  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  83.81 
 
 
327 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  80.58 
 
 
327 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  74.53 
 
 
327 aa  166  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  68.57 
 
 
342 aa  158  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  63.46 
 
 
322 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  47.92 
 
 
314 aa  95.9  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  40 
 
 
319 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  40.62 
 
 
316 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  44.33 
 
 
312 aa  77.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  38.78 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  38.78 
 
 
317 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  38.78 
 
 
317 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  39 
 
 
316 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  38.78 
 
 
320 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  37.76 
 
 
317 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  37.76 
 
 
317 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  38.24 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  42.27 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  41.67 
 
 
339 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  34.58 
 
 
304 aa  64.7  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  40 
 
 
339 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  35.58 
 
 
325 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  36.45 
 
 
311 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  34.34 
 
 
340 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  37.04 
 
 
334 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  33.64 
 
 
335 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  37 
 
 
326 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  34.31 
 
 
359 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  36.47 
 
 
346 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  31.68 
 
 
313 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  29.41 
 
 
302 aa  53.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  37.62 
 
 
319 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  32.71 
 
 
319 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  29.25 
 
 
328 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  34 
 
 
319 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  34 
 
 
319 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  34 
 
 
319 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  33.75 
 
 
322 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  32.61 
 
 
342 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  38.55 
 
 
319 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  31.25 
 
 
325 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  31 
 
 
321 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  31 
 
 
319 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  27 
 
 
313 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  26.04 
 
 
316 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  26.04 
 
 
316 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>