76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16190 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  100 
 
 
470 aa  935    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  42.83 
 
 
466 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  42.49 
 
 
466 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  42.83 
 
 
466 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  42.83 
 
 
466 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  42.83 
 
 
466 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  42.83 
 
 
466 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  42.39 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 
455 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  41.14 
 
 
474 aa  290  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  41.34 
 
 
462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  38.2 
 
 
465 aa  272  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  34.27 
 
 
442 aa  247  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.7 
 
 
453 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  36.01 
 
 
471 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  33.7 
 
 
466 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  33.26 
 
 
445 aa  236  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  36.71 
 
 
473 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  42.07 
 
 
1751 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  35.08 
 
 
455 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  37.09 
 
 
460 aa  223  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  37.09 
 
 
460 aa  223  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  33.26 
 
 
474 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 
445 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.68 
 
 
443 aa  217  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  35.28 
 
 
460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  32.62 
 
 
479 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  34.72 
 
 
469 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  34.34 
 
 
469 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36 
 
 
468 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.92 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  34.28 
 
 
444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  31.87 
 
 
453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  31.29 
 
 
456 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  33.12 
 
 
467 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  31.17 
 
 
464 aa  193  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 
480 aa  192  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  31.58 
 
 
454 aa  190  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  32.76 
 
 
473 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  32.7 
 
 
467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  30.26 
 
 
471 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.62 
 
 
475 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  30.61 
 
 
499 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.86 
 
 
883 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
485 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.06 
 
 
482 aa  167  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
523 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  31.38 
 
 
478 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.94 
 
 
481 aa  156  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 
478 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  26.01 
 
 
468 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.89 
 
 
608 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  26.34 
 
 
633 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  24.95 
 
 
468 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  24.67 
 
 
466 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  31.76 
 
 
490 aa  87  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  23.81 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  20.08 
 
 
506 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  20.59 
 
 
500 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  20.59 
 
 
500 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  40.4 
 
 
125 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  24.14 
 
 
494 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  35.53 
 
 
659 aa  57  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  25 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  31.46 
 
 
651 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  31.11 
 
 
477 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  28.78 
 
 
651 aa  50.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  24.45 
 
 
507 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.85 
 
 
417 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
479 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  30.05 
 
 
675 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  24.55 
 
 
534 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  24.89 
 
 
534 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  24.89 
 
 
534 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1820  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  30.08 
 
 
454 aa  43.1  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 
534 aa  43.1  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>