More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9147 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  100 
 
 		 288 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3914  PfkB domain-containing protein  35.84 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3872  PfkB domain protein  34.66 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3975  PfkB domain-containing protein  35.02 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.971364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3806  PfkB domain protein  35.02 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3794  PfkB domain protein  35.02 
 
 		 281 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0298  hypothetical protein  36.24 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  33.46 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  33.33 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  33.33 
 
 		 261 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 261 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  33.33 
 
 		 261 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  33.08 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5455  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354613  normal  0.536806 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3945  carbohydrate kinase, PfkB  31.88 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3647  xylose isomerase domain-containing protein  31.37 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0212849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  31.92 
 
 		 270 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.96 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  29.1 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3511  PfkB domain protein  31.23 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.46 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  29.1 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  28.76 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  27.05 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  28.41 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  31.85 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.4 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  29.04 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.8 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.81 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  27.95 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  24.15 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  29.29 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  27.52 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  29.55 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.04 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  28.45 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  28.46 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25.55 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  28.46 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  28.46 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  30.47 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  23.38 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.92 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  24.59 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  27.45 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  29.45 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.72 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  24.78 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.74 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  26.59 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  25.28 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  23.72 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.72 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  26.01 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  25.67 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  25.65 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  22.93 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  24.73 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  27 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  26.79 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  29.72 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  27.88 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  26.95 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  26.34 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  27.05 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  27.84 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.42 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  29.24 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  29.24 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.24 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  25.99 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.71 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  25.75 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  29.24 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  26.61 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  27.44 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.32 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  26.27 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  27 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  22.79 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  27.2 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  28.75 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  26.85 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  26.88 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  26.34 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  24.82 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  25.74 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  29.76 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  24.24 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  27.31 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  26.34 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  25.49 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>