39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5070 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5070  Major facilitator superfamily permease protein  100 
 
 		 400 aa  791    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  33.98 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 402 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0334  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 403 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00118696  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2183  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 407 aa  176  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362785  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  33.68 
 
 		 401 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4200  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.03 
 
 		 531 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  29.37 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 		 539 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  29.37 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 463 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 531 aa  47  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  27.89 
 
 		 683 aa  46.6  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0384  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  21.43 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 790 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.32 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 478 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  31.03 
 
 		 450 aa  43.1  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 450 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>