More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2916 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  62.69 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  61.19 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  57.21 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  57.07 
 
 		 220 aa  226  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  57.69 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  52.2 
 
 		 230 aa  205  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  48.33 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  49.28 
 
 		 234 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  49.51 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  50 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  49.28 
 
 		 246 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  49.24 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  49.24 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  49.04 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  35.93 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  32.47 
 
 		 771 aa  69.3  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.03 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.35 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.06 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  30.57 
 
 		 808 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.48 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.89 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.03 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2798  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 272 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31474  predicted protein  24.19 
 
 		 449 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.166066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.1 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.45 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  28.07 
 
 		 907 aa  52.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.62 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 352 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.71 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.66 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.6 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  39.25 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.36 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2716  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.61 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.66 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.11 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 317 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  30 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 365 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.98 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 362 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  27.74 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 261 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1091  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.98 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.86 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3054  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.97 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.79 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 262 aa  49.3  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 270 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.11 
 
 		 255 aa  48.9  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.82 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.08 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.41 
 
 		 234 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 440 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 273 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.63 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.41 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  26.49 
 
 		 238 aa  48.5  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.77 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  29.09 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3036  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.77 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  29.25 
 
 		 240 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.75 
 
 		 250 aa  48.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1908  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.08 
 
 		 251 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  27.03 
 
 		 266 aa  48.1  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  23.64 
 
 		 279 aa  48.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.97 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 350 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.91 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>