More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2404 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 363 aa  738    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  82.64 
 
 		 363 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  82.63 
 
 		 368 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1725  ABC transporter related  81.44 
 
 		 361 aa  591  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.897098 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  72.18 
 
 		 356 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  63.43 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  61.06 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4571  ABC transporter related  60.06 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  57.02 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.71 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  55.15 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  54.29 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.85 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  53.95 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.4 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  51.51 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  52.08 
 
 		 365 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.93 
 
 		 368 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  50.97 
 
 		 369 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  54.3 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.65 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.57 
 
 		 379 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  52.39 
 
 		 372 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.57 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  52.3 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  51.2 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  51.2 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  51.2 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  51.06 
 
 		 371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  50.82 
 
 		 367 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.6 
 
 		 372 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  52.17 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  49.31 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  50.41 
 
 		 384 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  50.56 
 
 		 353 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 		 386 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  51.36 
 
 		 371 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  51.36 
 
 		 371 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  50.41 
 
 		 384 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.72 
 
 		 384 aa  349  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  49.46 
 
 		 384 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 364 aa  349  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  51.25 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 		 371 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  51.52 
 
 		 360 aa  348  8e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  50.14 
 
 		 384 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  51.8 
 
 		 353 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  48.9 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  50 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  48.75 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  51.85 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50.84 
 
 		 374 aa  346  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  50.14 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  51.85 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.85 
 
 		 356 aa  345  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.85 
 
 		 356 aa  345  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.85 
 
 		 367 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.43 
 
 		 369 aa  345  8.999999999999999e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  49.45 
 
 		 367 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.91 
 
 		 386 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  47.99 
 
 		 386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  48.3 
 
 		 376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.72 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  51.57 
 
 		 356 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.85 
 
 		 356 aa  342  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.85 
 
 		 356 aa  342  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  51.37 
 
 		 363 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  51.45 
 
 		 366 aa  342  5.999999999999999e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  51.37 
 
 		 363 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.57 
 
 		 356 aa  342  7e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  49.72 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.56 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  49.03 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  48.75 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  48.77 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  49.43 
 
 		 381 aa  339  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  50.28 
 
 		 370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  47.17 
 
 		 370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  53.04 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.28 
 
 		 356 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  48.14 
 
 		 371 aa  338  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.65 
 
 		 370 aa  338  7e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  50.28 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  50.27 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  48.91 
 
 		 372 aa  337  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  50.41 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  50.56 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  49.71 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  46.15 
 
 		 371 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  50.14 
 
 		 371 aa  336  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  48.22 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.28 
 
 		 356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  48.55 
 
 		 366 aa  335  5e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  50.14 
 
 		 364 aa  335  7.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  47.87 
 
 		 371 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>