209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0001 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  78.39 
 
 		 273 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  77.66 
 
 		 273 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  73.99 
 
 		 273 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  67.16 
 
 		 272 aa  361  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  66.16 
 
 		 279 aa  350  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  66.16 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  58.97 
 
 		 279 aa  343  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  66.8 
 
 		 276 aa  340  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  55.97 
 
 		 279 aa  318  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  56.44 
 
 		 284 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  57.2 
 
 		 276 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  57.2 
 
 		 276 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  55.09 
 
 		 279 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  57.2 
 
 		 290 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  57.74 
 
 		 280 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  55.47 
 
 		 279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  54.72 
 
 		 279 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  55.76 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  53.7 
 
 		 279 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  56.02 
 
 		 280 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  56.13 
 
 		 283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  54.14 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  53.03 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  50.75 
 
 		 279 aa  289  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  53.79 
 
 		 277 aa  288  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  55.02 
 
 		 276 aa  288  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  50.37 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  49.43 
 
 		 270 aa  259  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  48.66 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  47.51 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  47.19 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  43.87 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  40.08 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  41.47 
 
 		 275 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  38.66 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  41.22 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  37.12 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  36.54 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  39 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  36.26 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  36.26 
 
 		 270 aa  175  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  36.43 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  35.88 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  35.09 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  36.68 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  38.22 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  35.42 
 
 		 288 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  36.43 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  34.96 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  33.94 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  32.71 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  35.32 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  31.4 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  35 
 
 		 269 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  36.96 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  34.36 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  33.46 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  33.08 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  30.89 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  34.12 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  34.6 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  34.5 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  31.97 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  33.85 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  33.72 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  33.94 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  32.43 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  34.24 
 
 		 276 aa  139  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  31.78 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  32.57 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  31.06 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  30.51 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  35.23 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  35.08 
 
 		 411 aa  129  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  34.6 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2427  protein of unknown function DUF299  35.69 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  33.83 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  34.04 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  34.28 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02383  hypothetical protein  33.58 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2834  hypothetical protein  33.92 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1434  hypothetical protein  32.01 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.855311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1769  hypothetical protein  31.56 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  33.46 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  33.46 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5313  hypothetical protein  33.09 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0599307  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33216  predicted protein  27.87 
 
 		 513 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0330963  normal  0.247759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>