208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1272 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  93.48 
 
 
276 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  82.91 
 
 
276 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  82.55 
 
 
276 aa  477  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  82.91 
 
 
290 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  82.61 
 
 
276 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  70.07 
 
 
284 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  64.73 
 
 
277 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  67.88 
 
 
283 aa  358  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  63.5 
 
 
279 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  61.19 
 
 
279 aa  349  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  63.12 
 
 
279 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  62.36 
 
 
279 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  61.98 
 
 
279 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  60.82 
 
 
274 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  61.65 
 
 
280 aa  339  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  62.5 
 
 
280 aa  338  7e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  62.74 
 
 
272 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  60.61 
 
 
273 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  57.09 
 
 
273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  57.79 
 
 
273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  56.99 
 
 
274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  55.06 
 
 
279 aa  311  4.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  58.58 
 
 
279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  55.76 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  58.58 
 
 
342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  52.9 
 
 
279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  54.96 
 
 
300 aa  300  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  54.75 
 
 
280 aa  296  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  58.15 
 
 
276 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  53.05 
 
 
270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  50.56 
 
 
292 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  47.19 
 
 
282 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  46.9 
 
 
275 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  38.2 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  43.77 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  38.85 
 
 
273 aa  206  3e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  38.08 
 
 
273 aa  206  4e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  41 
 
 
270 aa  202  3e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  41.13 
 
 
269 aa  201  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  39.77 
 
 
270 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  39.38 
 
 
270 aa  198  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  39.31 
 
 
269 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  39.1 
 
 
280 aa  185  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  38.91 
 
 
269 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  36.98 
 
 
273 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  39.92 
 
 
267 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  36.68 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  37.07 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  38.08 
 
 
273 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  34.75 
 
 
277 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  36.82 
 
 
278 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  35.16 
 
 
268 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  35.16 
 
 
272 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  34.36 
 
 
278 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  35.66 
 
 
288 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  33.85 
 
 
270 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  36.98 
 
 
327 aa  158  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  35.96 
 
 
269 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  38.52 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  32.82 
 
 
286 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  33.2 
 
 
266 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  34.34 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  34.34 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  34.34 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  34.34 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  34.34 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  34.34 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  34.34 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  33.71 
 
 
269 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  34.34 
 
 
270 aa  148  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  31.7 
 
 
272 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  31.7 
 
 
272 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  32.45 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  30.12 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  34.34 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  33.96 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  34.72 
 
 
270 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  34.87 
 
 
266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  31.27 
 
 
277 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  32.7 
 
 
270 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  32.68 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  31.85 
 
 
307 aa  138  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  30 
 
 
276 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  35.19 
 
 
277 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  30.42 
 
 
276 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  33.69 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  38.19 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  38.19 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  36.53 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  38.93 
 
 
273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2049  hypothetical protein  39.72 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1758  hypothetical protein  35.66 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.572502  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2400  hypothetical protein  37.28 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.238521  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00923  hypothetical protein  36.1 
 
 
267 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2421  hypothetical protein  35.92 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.170649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2190  hypothetical protein  35.36 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2291  hypothetical protein  33.1 
 
 
272 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3043  hypothetical protein  37.14 
 
 
273 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>