208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2832 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  74.72 
 
 		 280 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  69.89 
 
 		 270 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  56.44 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  56.99 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  53.87 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  54.55 
 
 		 279 aa  308  5e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  54.68 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  57.46 
 
 		 276 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  53.53 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  53.18 
 
 		 276 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  53.18 
 
 		 290 aa  292  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  53.85 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  53.18 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  50.57 
 
 		 279 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  50.57 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  51.32 
 
 		 280 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  50.19 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  275  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  48.52 
 
 		 279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  49.81 
 
 		 279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  52.83 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  48.66 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  45.59 
 
 		 273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  45.21 
 
 		 273 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  47.13 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  45.04 
 
 		 279 aa  245  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  45.76 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  45.76 
 
 		 342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  44.96 
 
 		 275 aa  234  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  45.67 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  45.71 
 
 		 292 aa  228  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  43.63 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  41.82 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  40.82 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  40.84 
 
 		 269 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  40.91 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  41.31 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  39.47 
 
 		 273 aa  206  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  40.93 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  40.93 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  37.22 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  39.38 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  41.25 
 
 		 269 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  39.39 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  36.78 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  37.69 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  37.98 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  37.83 
 
 		 294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  34.19 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  34.19 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  38.35 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  33.46 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  36.78 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  37.6 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  34.11 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  36.64 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  35.71 
 
 		 288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  36.36 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  36.64 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  35.27 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  36.76 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  35.98 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  36.74 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  34.75 
 
 		 283 aa  165  9e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  32.71 
 
 		 270 aa  165  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  39.7 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  34.96 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  35.02 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  35.41 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  35.34 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  33.46 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  35.07 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  38.58 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  33.58 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1242  protein of unknown function DUF299  31.94 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  32.95 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  35.77 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2427  protein of unknown function DUF299  34.19 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  32.58 
 
 		 307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  29.39 
 
 		 411 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  35 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0997  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.292387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2204  hypothetical protein  33.57 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000647  hypothetical protein  34.94 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2578  hypothetical protein  33.46 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.3778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0999  protein of unknown function DUF299  32.09 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2834  hypothetical protein  33.58 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02383  hypothetical protein  33.71 
 
 		 270 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33216  predicted protein  29.77 
 
 		 513 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0330963  normal  0.247759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>