209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3209 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  77.29 
 
 		 273 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  77.66 
 
 		 273 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  73.99 
 
 		 273 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  68.03 
 
 		 272 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  65.4 
 
 		 279 aa  354  8.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  65.4 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  67.19 
 
 		 276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  58.97 
 
 		 279 aa  351  8e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  60.61 
 
 		 276 aa  332  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  56.82 
 
 		 284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  55.97 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  55.97 
 
 		 279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  58.71 
 
 		 276 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  58.71 
 
 		 290 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  58.71 
 
 		 276 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  61.36 
 
 		 283 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  57.58 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  55.89 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  55.89 
 
 		 279 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  56.88 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  55.13 
 
 		 279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  59.55 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  54.79 
 
 		 280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  54.79 
 
 		 280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  50.96 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  52.27 
 
 		 277 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  49.81 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  48.66 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  48.28 
 
 		 280 aa  256  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  47.13 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  47.21 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  45.69 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  41.86 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  40.91 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  38.01 
 
 		 276 aa  205  8e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  37.83 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  41 
 
 		 270 aa  200  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  41.31 
 
 		 269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  39.08 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  36.33 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  39.08 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  39.15 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  39.54 
 
 		 273 aa  188  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  36.4 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  37.35 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  36.82 
 
 		 280 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  37.98 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  36.09 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  35.11 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  33.46 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  39.3 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  36.74 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  32.18 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  32.95 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  33.2 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  33.2 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  34.24 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  36.74 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  33.21 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  35.82 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  33.21 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  34.75 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  35 
 
 		 294 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  33.82 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  34.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  35.25 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  32.69 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  31.68 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  34.78 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  33.98 
 
 		 276 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  32.31 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  34.94 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  36.7 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  30.34 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  34.46 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  35.53 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  35.53 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  35.21 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1758  hypothetical protein  32.09 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.572502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  33.58 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2204  hypothetical protein  34.89 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1520  hypothetical protein  34.39 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1743  hypothetical protein  32.84 
 
 		 270 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2190  hypothetical protein  32.28 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3043  hypothetical protein  34.39 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2427  protein of unknown function DUF299  33.83 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.238521  normal  0.776815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>