208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3935 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  97.44 
 
 
273 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  77.29 
 
 
273 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  77.66 
 
 
273 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  66.05 
 
 
272 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  66.79 
 
 
279 aa  360  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  67.68 
 
 
342 aa  359  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  66.67 
 
 
276 aa  350  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  57.51 
 
 
279 aa  335  5.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  56.72 
 
 
279 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  55.13 
 
 
279 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  55.51 
 
 
279 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  54.81 
 
 
279 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  56.27 
 
 
284 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  54.37 
 
 
279 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  57.79 
 
 
276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  56.65 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  56.65 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  56.65 
 
 
290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  58.21 
 
 
283 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  55.17 
 
 
280 aa  305  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  54.02 
 
 
280 aa  299  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  53.99 
 
 
276 aa  293  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  54.51 
 
 
274 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  56.34 
 
 
276 aa  288  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  50.57 
 
 
279 aa  280  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  52.11 
 
 
277 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  49.05 
 
 
300 aa  260  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  45.21 
 
 
274 aa  251  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  46.36 
 
 
270 aa  246  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  45.98 
 
 
280 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  46.04 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  43.49 
 
 
292 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  36.94 
 
 
276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  39.92 
 
 
275 aa  198  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  37.93 
 
 
269 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  39 
 
 
269 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  38.17 
 
 
270 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  38.17 
 
 
270 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  35.96 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  36.43 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  38.7 
 
 
270 aa  175  6e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  34.19 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  37.07 
 
 
268 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  34.62 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  35.38 
 
 
273 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  32.68 
 
 
277 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  33.83 
 
 
280 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  34.1 
 
 
273 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  35.85 
 
 
288 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  33.72 
 
 
269 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  32.94 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  32.94 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  33.73 
 
 
272 aa  149  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  33.72 
 
 
269 aa  148  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  30.89 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  32.96 
 
 
272 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  31.44 
 
 
286 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  34.24 
 
 
267 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  32.42 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  32.95 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  31.8 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  32.44 
 
 
283 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  33.08 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  32.97 
 
 
327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  32.57 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  32.84 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  32.06 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  33.96 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  32.69 
 
 
266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  30.5 
 
 
266 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  30.89 
 
 
270 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  29.66 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  31.64 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  29.52 
 
 
307 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  32.71 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  33.87 
 
 
411 aa  122  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  31.95 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  30.86 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41680  hypothetical protein  30.07 
 
 
274 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2427  protein of unknown function DUF299  32.6 
 
 
274 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3538  hypothetical protein  30.07 
 
 
272 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1520  hypothetical protein  33.57 
 
 
272 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  32.62 
 
 
276 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  32.62 
 
 
276 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2084  hypothetical protein  29.96 
 
 
272 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00711246  normal  0.0225535 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33216  predicted protein  27.54 
 
 
513 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0330963  normal  0.247759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2400  hypothetical protein  30.51 
 
 
273 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.238521  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3043  hypothetical protein  31.58 
 
 
273 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>