208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1129 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  552  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  88.24 
 
 
272 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  88.24 
 
 
272 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  53.87 
 
 
270 aa  298  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  54.98 
 
 
270 aa  298  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  54.98 
 
 
270 aa  298  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  54.98 
 
 
270 aa  298  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  54.98 
 
 
270 aa  298  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  54.98 
 
 
270 aa  298  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  54.98 
 
 
270 aa  298  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  54.98 
 
 
270 aa  298  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  54.24 
 
 
270 aa  298  9e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  54.24 
 
 
270 aa  298  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  54.61 
 
 
270 aa  296  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  57.03 
 
 
266 aa  295  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  56.23 
 
 
266 aa  295  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  52.47 
 
 
278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  49.62 
 
 
286 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  49.43 
 
 
273 aa  267  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  47.29 
 
 
269 aa  262  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  48.08 
 
 
277 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  46.92 
 
 
273 aa  259  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  44.28 
 
 
288 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  47.49 
 
 
277 aa  258  9e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  47.69 
 
 
294 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  45.04 
 
 
266 aa  242  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  42.48 
 
 
269 aa  241  7e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  44.07 
 
 
270 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  44.03 
 
 
276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  43.82 
 
 
270 aa  228  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  42.31 
 
 
269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  42.64 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  41.83 
 
 
267 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  42.41 
 
 
283 aa  206  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  40.3 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  39.62 
 
 
276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  39.53 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  40 
 
 
269 aa  195  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  39.23 
 
 
269 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  37.07 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  37.69 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  37.07 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  33.95 
 
 
270 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  37.93 
 
 
269 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  33.46 
 
 
274 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  33.96 
 
 
280 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1242  protein of unknown function DUF299  32.08 
 
 
271 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  32.18 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  34.09 
 
 
276 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  34.1 
 
 
279 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  34.69 
 
 
291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  34.56 
 
 
327 aa  155  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  33.21 
 
 
276 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  33.21 
 
 
276 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  33.21 
 
 
290 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  33.72 
 
 
279 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  32.84 
 
 
279 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  31.68 
 
 
279 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  34.24 
 
 
273 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  35.53 
 
 
277 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  31.11 
 
 
411 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  31.7 
 
 
276 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  31.87 
 
 
307 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  33.73 
 
 
273 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  32.83 
 
 
280 aa  149  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  33.73 
 
 
273 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  32.45 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  35.29 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  31.85 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  30.94 
 
 
284 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  29.21 
 
 
300 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  34.12 
 
 
273 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  32.17 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  30.68 
 
 
274 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  31.68 
 
 
273 aa  144  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  34.08 
 
 
283 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  32.55 
 
 
272 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  28.52 
 
 
282 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  30.92 
 
 
273 aa  141  9e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  30.71 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  30.53 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  29.2 
 
 
292 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  30.94 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  30.6 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  30.6 
 
 
342 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  32.7 
 
 
276 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  31.82 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  32.47 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33216  predicted protein  29.3 
 
 
513 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0330963  normal  0.247759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2204  hypothetical protein  30.39 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000499041  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2834  hypothetical protein  28.77 
 
 
273 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0617  hypothetical protein  27.65 
 
 
258 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0997  hypothetical protein  31.11 
 
 
282 aa  106  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.292387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1520  hypothetical protein  29.82 
 
 
272 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  27.65 
 
 
270 aa  105  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06516  hypothetical protein  29.67 
 
 
278 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000647  hypothetical protein  28.16 
 
 
278 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2036  hypothetical protein  28.16 
 
 
271 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613437  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1905  hypothetical protein  28.16 
 
 
271 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.617722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>