209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2427 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2427  protein of unknown function DUF299  100 
 
 
274 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1498  hypothetical protein  43.68 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2870  protein of unknown function DUF299  44.91 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1485  hypothetical protein  43.3 
 
 
271 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1452  hypothetical protein  42.69 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000190114  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1865  hypothetical protein  42.26 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0336096  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1322  hypothetical protein  44.87 
 
 
277 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2656  hypothetical protein  44.36 
 
 
314 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000624696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1758  hypothetical protein  42.91 
 
 
272 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.572502  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5313  hypothetical protein  43.13 
 
 
271 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0599307  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6074  hypothetical protein  43.13 
 
 
271 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2003  hypothetical protein  43.13 
 
 
271 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2023  hypothetical protein  43.13 
 
 
271 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0775457  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2439  hypothetical protein  44.49 
 
 
271 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.0202709 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1698  hypothetical protein  44.49 
 
 
287 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1420  hypothetical protein  41.79 
 
 
279 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.0263307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1905  hypothetical protein  43.51 
 
 
271 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2036  hypothetical protein  43.51 
 
 
271 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613437  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1273  hypothetical protein  43.77 
 
 
271 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0122  protein of unknown function DUF299  42.37 
 
 
283 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1889  hypothetical protein  42.31 
 
 
274 aa  204  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.213154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1520  hypothetical protein  43.68 
 
 
272 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0549  hypothetical protein  42.8 
 
 
273 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.10493  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1361  hypothetical protein  41.76 
 
 
283 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0594  hypothetical protein  43.18 
 
 
273 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.201513  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1297  hypothetical protein  41.76 
 
 
283 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0133713  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1736  hypothetical protein  41.33 
 
 
273 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1842  hypothetical protein  41.33 
 
 
273 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2421  hypothetical protein  43.56 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.170649 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1434  hypothetical protein  43.68 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.855311  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3043  hypothetical protein  43.51 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2834  hypothetical protein  43.51 
 
 
273 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1406  hypothetical protein  39.18 
 
 
267 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.968755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2400  hypothetical protein  43.89 
 
 
273 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.238521  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2173  hypothetical protein  41.24 
 
 
292 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0501659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  45.42 
 
 
273 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  44.44 
 
 
273 aa  198  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2043  hypothetical protein  41.44 
 
 
271 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000286207  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  45.42 
 
 
276 aa  198  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  45.42 
 
 
276 aa  198  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1539  hypothetical protein  41.44 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000339618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2566  hypothetical protein  41.44 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0997  hypothetical protein  40.46 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.292387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2039  hypothetical protein  41.44 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000106552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3272  hypothetical protein  41.44 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000389309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2420  hypothetical protein  41.44 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000632671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2476  hypothetical protein  41.44 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00018837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1311  hypothetical protein  41.44 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000394602  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1477  hypothetical protein  41.42 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1997  hypothetical protein  41.42 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.140597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1459  hypothetical protein  41.42 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1825  hypothetical protein  41.42 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1443  hypothetical protein  41.42 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.222292  normal  0.0952573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2204  hypothetical protein  42.07 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000499041  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02383  hypothetical protein  41.92 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2063  hypothetical protein  40 
 
 
277 aa  194  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.557113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1884  hypothetical protein  39.62 
 
 
271 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2049  hypothetical protein  43.13 
 
 
273 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1815  hypothetical protein  43.89 
 
 
273 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01672  hypothetical protein  40.67 
 
 
277 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1939  protein of unknown function DUF299  40.67 
 
 
277 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1783  hypothetical protein  40.67 
 
 
277 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00923  hypothetical protein  41.67 
 
 
267 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1928  hypothetical protein  40.67 
 
 
277 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.868856  normal  0.230597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01661  hypothetical protein  40.67 
 
 
277 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.311887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1487  hypothetical protein  40.67 
 
 
277 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.88593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1921  hypothetical protein  40.67 
 
 
277 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2421  hypothetical protein  40.67 
 
 
277 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0219  hypothetical protein  43.12 
 
 
273 aa  192  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1744  hypothetical protein  40.67 
 
 
277 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59069  normal  0.0126649 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1656  hypothetical protein  38.58 
 
 
273 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2759  hypothetical protein  39.33 
 
 
273 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1334  hypothetical protein  40.38 
 
 
298 aa  192  6e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0121091  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1035  hypothetical protein  40.38 
 
 
298 aa  192  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0046897  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0617  hypothetical protein  41.09 
 
 
258 aa  192  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2457  hypothetical protein  39.33 
 
 
285 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0950  hypothetical protein  40.23 
 
 
299 aa  192  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034537  hitchhiker  0.00814679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1907  hypothetical protein  40.3 
 
 
277 aa  191  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2933  hypothetical protein  46.29 
 
 
299 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1743  hypothetical protein  41.92 
 
 
270 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1769  hypothetical protein  37.07 
 
 
272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128839  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1688  hypothetical protein  39.55 
 
 
273 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41680  hypothetical protein  37.69 
 
 
274 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1599  hypothetical protein  38.08 
 
 
272 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.852515  hitchhiker  0.0000000322533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1592  hypothetical protein  37.69 
 
 
272 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252196  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3538  hypothetical protein  37.69 
 
 
272 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2298  hypothetical protein  38.49 
 
 
270 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000577143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3659  hypothetical protein  37.69 
 
 
272 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717061  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2081  hypothetical protein  37.69 
 
 
272 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2244  hypothetical protein  38.49 
 
 
270 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.277216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2578  hypothetical protein  39.92 
 
 
271 aa  185  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.3778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2010  hypothetical protein  38.49 
 
 
270 aa  185  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1548  hypothetical protein  38.26 
 
 
270 aa  185  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000386745  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2073  hypothetical protein  37.88 
 
 
270 aa  185  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2089  hypothetical protein  36.68 
 
 
272 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2084  hypothetical protein  37.69 
 
 
272 aa  184  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00711246  normal  0.0225535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2645  hypothetical protein  38.35 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2482  hypothetical protein  38.87 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1591  hypothetical protein  38.35 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00125366  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1666  hypothetical protein  38.35 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00389139  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>