208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3570 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  584  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  70.48 
 
 
277 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  70.07 
 
 
276 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  67.27 
 
 
276 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  67.78 
 
 
276 aa  388  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  68.15 
 
 
276 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  67.78 
 
 
290 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  68.98 
 
 
276 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  62.77 
 
 
283 aa  351  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  60.22 
 
 
279 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  60.22 
 
 
279 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  60.58 
 
 
279 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  58.76 
 
 
279 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  60.59 
 
 
280 aa  349  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  59.85 
 
 
280 aa  348  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  61.89 
 
 
272 aa  344  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  58.3 
 
 
279 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  58.15 
 
 
274 aa  326  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  56.82 
 
 
273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  51.45 
 
 
279 aa  316  3e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  56.27 
 
 
273 aa  314  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  56.27 
 
 
273 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  56.44 
 
 
273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  54.14 
 
 
279 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  53.87 
 
 
274 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  55.56 
 
 
279 aa  309  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  55.56 
 
 
342 aa  308  8e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  56.3 
 
 
276 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  52.92 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  53.53 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  51.89 
 
 
270 aa  296  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  48.06 
 
 
292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  45.28 
 
 
282 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  43.58 
 
 
275 aa  225  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  39.02 
 
 
276 aa  217  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  40.08 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  40.23 
 
 
269 aa  205  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  37.64 
 
 
273 aa  204  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  37.4 
 
 
273 aa  202  4e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  37.45 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  36.54 
 
 
270 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  36.15 
 
 
270 aa  195  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  36.78 
 
 
269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  36.6 
 
 
273 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  36.16 
 
 
280 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  37.74 
 
 
269 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  34.77 
 
 
268 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  35.85 
 
 
288 aa  175  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  33.59 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  34.36 
 
 
273 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  34.46 
 
 
283 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  34.94 
 
 
269 aa  165  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  33.85 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  34.21 
 
 
294 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  35.14 
 
 
267 aa  162  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  34.33 
 
 
286 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  35.77 
 
 
266 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  32.05 
 
 
278 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  31.67 
 
 
277 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  35.61 
 
 
269 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  30.57 
 
 
272 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  30.57 
 
 
272 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  33.2 
 
 
266 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  29.43 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  30.94 
 
 
272 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  32.3 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  32.42 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  36.06 
 
 
296 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  32.56 
 
 
278 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  33.71 
 
 
327 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  33.08 
 
 
266 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  31.64 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  31.58 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  31.58 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  31.58 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  31.58 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  31.58 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  31.58 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  31.58 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  31.58 
 
 
270 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  31.58 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1758  hypothetical protein  33.92 
 
 
272 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.572502  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  31.2 
 
 
270 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  32.33 
 
 
270 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  30.65 
 
 
270 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  33.45 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0997  hypothetical protein  32.52 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.292387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1865  hypothetical protein  36.73 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0336096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  31.01 
 
 
276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  32.51 
 
 
307 aa  132  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2427  protein of unknown function DUF299  35.19 
 
 
274 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  32.84 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1452  hypothetical protein  36.36 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000190114  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  37.1 
 
 
411 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0617  hypothetical protein  34.83 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0219  hypothetical protein  34.4 
 
 
273 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1420  hypothetical protein  34.91 
 
 
279 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.0263307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2190  hypothetical protein  32.46 
 
 
273 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2421  hypothetical protein  33.21 
 
 
273 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.170649 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  33.71 
 
 
273 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>