209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2470 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  72.99 
 
 
277 aa  411  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  70.41 
 
 
269 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  64.94 
 
 
277 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  64.26 
 
 
273 aa  358  8e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  62.26 
 
 
278 aa  355  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  61.19 
 
 
273 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  60.38 
 
 
294 aa  329  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  56.32 
 
 
266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  55.56 
 
 
266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  55.81 
 
 
270 aa  295  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  55.04 
 
 
270 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  55.04 
 
 
270 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  55.04 
 
 
270 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  55.04 
 
 
270 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  55.04 
 
 
270 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  55.04 
 
 
270 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  55.04 
 
 
270 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  55.43 
 
 
270 aa  293  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  55.04 
 
 
270 aa  292  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  54.65 
 
 
270 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  49.62 
 
 
272 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  51.88 
 
 
266 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  51.79 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  50.39 
 
 
272 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  50.39 
 
 
272 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  51.94 
 
 
269 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  48.11 
 
 
276 aa  261  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  48.85 
 
 
288 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  46.88 
 
 
270 aa  255  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  44.4 
 
 
266 aa  238  8e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  47.13 
 
 
272 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  43.02 
 
 
269 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  41.09 
 
 
269 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  41.83 
 
 
269 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  41.47 
 
 
267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  40.23 
 
 
283 aa  209  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  40.08 
 
 
280 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  41.86 
 
 
276 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  40.86 
 
 
270 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  40.86 
 
 
270 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  42.02 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  40.08 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  40.77 
 
 
270 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1242  protein of unknown function DUF299  36.96 
 
 
271 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  37.84 
 
 
280 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  36.88 
 
 
278 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  37.6 
 
 
274 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  37.74 
 
 
275 aa  175  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  38.15 
 
 
327 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  37.5 
 
 
276 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  34.09 
 
 
274 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  35.27 
 
 
279 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  33.82 
 
 
307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  36.13 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  33.83 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  34.33 
 
 
284 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  36.47 
 
 
277 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  31.94 
 
 
300 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  32.21 
 
 
279 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  32.18 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  36.26 
 
 
291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  32.58 
 
 
280 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  32.21 
 
 
411 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  32.82 
 
 
276 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  32.82 
 
 
276 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  32.82 
 
 
290 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  31.84 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  32.43 
 
 
276 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  32.82 
 
 
276 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  31.84 
 
 
279 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  31.46 
 
 
279 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  31.72 
 
 
273 aa  148  9e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  30.89 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  32.21 
 
 
292 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  29.92 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  31.44 
 
 
273 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  31.56 
 
 
273 aa  144  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  31.82 
 
 
273 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  30.04 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  33.08 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  30.94 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  29.83 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  34.3 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  30.83 
 
 
282 aa  139  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  32.32 
 
 
276 aa  137  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  30.45 
 
 
279 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1273  hypothetical protein  35.42 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33216  predicted protein  31.27 
 
 
513 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0330963  normal  0.247759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5313  hypothetical protein  34.32 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0599307  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2023  hypothetical protein  34.69 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0775457  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6074  hypothetical protein  34.69 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2003  hypothetical protein  34.69 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1905  hypothetical protein  34.32 
 
 
271 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2036  hypothetical protein  34.32 
 
 
271 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613437  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2566  hypothetical protein  35.06 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2420  hypothetical protein  35.06 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000632671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2476  hypothetical protein  35.06 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00018837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1311  hypothetical protein  35.06 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000394602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>