208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0395 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  97.49 
 
 		 279 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  95.7 
 
 		 279 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  89.13 
 
 		 279 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  84.59 
 
 		 279 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  86.55 
 
 		 280 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  83.82 
 
 		 280 aa  472  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  63.14 
 
 		 283 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  64.64 
 
 		 276 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  64.64 
 
 		 290 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  63.88 
 
 		 276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  60.22 
 
 		 284 aa  352  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  63.5 
 
 		 276 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  63.06 
 
 		 276 aa  346  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  62.74 
 
 		 276 aa  326  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  58.78 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  56.55 
 
 		 274 aa  321  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  57.41 
 
 		 272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  54.37 
 
 		 273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  53.99 
 
 		 273 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  55.47 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  53.14 
 
 		 279 aa  305  7e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  55.89 
 
 		 273 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  54.89 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  48.75 
 
 		 279 aa  299  3e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  55.19 
 
 		 279 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  55.19 
 
 		 342 aa  296  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  55.86 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  49.81 
 
 		 270 aa  278  9e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  50.19 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  50.19 
 
 		 280 aa  275  7e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  45.42 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  46.45 
 
 		 292 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  46.18 
 
 		 275 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  36.98 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  40.84 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  36.43 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  34.83 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  38.78 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  38.81 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  38.7 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  36.4 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  34.98 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  34.96 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  34.98 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  34.36 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  33.94 
 
 		 280 aa  168  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  37.08 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  35.45 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  35.23 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  34.1 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  35.02 
 
 		 268 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  33.08 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  34.1 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  35.23 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  33.46 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  33.46 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  34.43 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  33.46 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  37.07 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  32.33 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  31.84 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  35.61 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  31.23 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  31.4 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  34.62 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  29.12 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  31.46 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  32.18 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  34.98 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  32.96 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  32.71 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  33.46 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  33.09 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  31.64 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  29.96 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  32.31 
 
 		 411 aa  133  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  32.71 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  32.96 
 
 		 296 aa  128  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  28.57 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1520  hypothetical protein  32.73 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  32.6 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2427  protein of unknown function DUF299  31.9 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1758  hypothetical protein  33.57 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.572502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  31.62 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  31.62 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2400  hypothetical protein  31.75 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.238521  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3043  hypothetical protein  31.16 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  32.25 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2049  hypothetical protein  34.41 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2656  hypothetical protein  34.28 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000624696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>