208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11040 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  638    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  55.56 
 
 
296 aa  291  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  54.09 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  36.79 
 
 
273 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  39.03 
 
 
280 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  38.18 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  38.52 
 
 
267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  35.32 
 
 
278 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  36.8 
 
 
269 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  37.17 
 
 
269 aa  178  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  35.56 
 
 
273 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  35.51 
 
 
269 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  36.06 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  37.08 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  36.08 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  32.34 
 
 
270 aa  172  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  34.19 
 
 
286 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  35 
 
 
277 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  37.41 
 
 
269 aa  168  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  34.94 
 
 
276 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  35.04 
 
 
266 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  35.29 
 
 
266 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  35.45 
 
 
270 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  35.45 
 
 
270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  35.45 
 
 
266 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  35.69 
 
 
270 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  35.19 
 
 
269 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  35.93 
 
 
270 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  36.59 
 
 
327 aa  159  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  35.56 
 
 
270 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  32.6 
 
 
272 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  35.19 
 
 
270 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  35.19 
 
 
270 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  35.19 
 
 
270 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  35.19 
 
 
270 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  35.19 
 
 
270 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  35.19 
 
 
270 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  35.19 
 
 
270 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  35.19 
 
 
270 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  32.71 
 
 
283 aa  155  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  32.22 
 
 
280 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  33.58 
 
 
288 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1242  protein of unknown function DUF299  30.86 
 
 
271 aa  152  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  33.58 
 
 
300 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  31.87 
 
 
272 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  32.01 
 
 
276 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  31.87 
 
 
272 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  34.07 
 
 
270 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  31.48 
 
 
272 aa  149  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  148  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  36.73 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  30.69 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  30.69 
 
 
279 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  32.59 
 
 
266 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  30.32 
 
 
279 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  30.47 
 
 
279 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  31.85 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  32.58 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  29.96 
 
 
279 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  32.59 
 
 
276 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  29.15 
 
 
270 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  30.99 
 
 
290 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  28.67 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  31.85 
 
 
276 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  31.64 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  29.03 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  32.29 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  30.51 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  29.89 
 
 
276 aa  132  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  29.48 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  30 
 
 
276 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  29.89 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  31.58 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  32.09 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  29.52 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  32.01 
 
 
411 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  30.6 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  28.21 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  31.5 
 
 
282 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  31.85 
 
 
276 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  30.34 
 
 
273 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  31.97 
 
 
342 aa  122  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  31.97 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  28.94 
 
 
273 aa  122  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  29.71 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  28.88 
 
 
273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  26.95 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  29.96 
 
 
270 aa  120  3e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  29.78 
 
 
272 aa  119  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  31.06 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0252  hypothetical protein  32.48 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1420  hypothetical protein  33.1 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.0263307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1865  hypothetical protein  32.39 
 
 
301 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0336096  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1361  hypothetical protein  32.19 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33216  predicted protein  30.55 
 
 
513 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0330963  normal  0.247759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1297  hypothetical protein  31.85 
 
 
283 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0133713  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1452  hypothetical protein  32.63 
 
 
270 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000190114  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2036  hypothetical protein  32.17 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613437  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1905  hypothetical protein  32.17 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1273  hypothetical protein  32.17 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>