209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3384 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  79.55 
 
 		 269 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  66.03 
 
 		 269 aa  374  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  66.16 
 
 		 270 aa  371  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  66.16 
 
 		 270 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  58.71 
 
 		 280 aa  335  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  61.22 
 
 		 269 aa  325  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  54.62 
 
 		 268 aa  298  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  46.88 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  43.4 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  43.45 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  43.02 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  44.57 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  43.02 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  44.49 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  41.86 
 
 		 269 aa  218  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  41.92 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  43.18 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  40.62 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  42.08 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  40.23 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  40.93 
 
 		 274 aa  204  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  41.7 
 
 		 269 aa  202  7e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  41.13 
 
 		 276 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  38.76 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  43.41 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  39.38 
 
 		 270 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  38.7 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  41.22 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  41.22 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  40.84 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  40.84 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  40.84 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  40.84 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  40.84 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  40.84 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  40.84 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  40.38 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  40.84 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  40.38 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  40 
 
 		 272 aa  195  5.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  40.84 
 
 		 270 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  40.15 
 
 		 276 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  39.08 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  40.15 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  40.15 
 
 		 276 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  40.82 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  39.69 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  39.02 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  38.93 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  39.38 
 
 		 273 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  38.81 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  37.97 
 
 		 280 aa  191  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  41.31 
 
 		 273 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  40.23 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  39 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  38.43 
 
 		 279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  38.11 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  39.38 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  38.43 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  37.55 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  37.16 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  36.94 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  40.75 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  37.07 
 
 		 274 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  40.46 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  40.38 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  40.47 
 
 		 276 aa  181  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  38.49 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  39 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  36.68 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  39.42 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  41.47 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  37.31 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  39.62 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  36.88 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  37.64 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  35.96 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  37.31 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  36.54 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  40.45 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1242  protein of unknown function DUF299  36.78 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  36.43 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  36.43 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  39.33 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  38.2 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  39.7 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  34.87 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33216  predicted protein  30.03 
 
 		 513 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0330963  normal  0.247759 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  30.97 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  32.37 
 
 		 411 aa  137  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  34.89 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  34.89 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1452  hypothetical protein  36.69 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000190114  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  34.89 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1273  hypothetical protein  35.97 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1905  hypothetical protein  35.97 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2036  hypothetical protein  35.97 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2190  hypothetical protein  32.97 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1420  hypothetical protein  35.38 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.0263307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>