208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0347 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  37.41 
 
 
277 aa  195  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  37.5 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  35.77 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  36.72 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  37.11 
 
 
277 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  36.5 
 
 
270 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  35.36 
 
 
272 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  36.5 
 
 
270 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  35.36 
 
 
272 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  36.5 
 
 
270 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  36.12 
 
 
270 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  36.12 
 
 
270 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  36.12 
 
 
270 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  36.12 
 
 
270 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  36.12 
 
 
270 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  36.12 
 
 
270 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  36.12 
 
 
270 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  37.5 
 
 
286 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  36.68 
 
 
273 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  35.47 
 
 
278 aa  168  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  36.5 
 
 
266 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  36.12 
 
 
270 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  34.83 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  34.22 
 
 
269 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  32.58 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  34.09 
 
 
272 aa  162  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  33.46 
 
 
268 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  33.71 
 
 
270 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  33.71 
 
 
270 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  34.33 
 
 
275 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  35.63 
 
 
270 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  33.71 
 
 
269 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  33.96 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  33.46 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  34.24 
 
 
288 aa  152  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  37.31 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  35.32 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  33.98 
 
 
283 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  34.34 
 
 
266 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  33.46 
 
 
274 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  32.83 
 
 
280 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  34.6 
 
 
273 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  34.1 
 
 
279 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  34.43 
 
 
267 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  33.59 
 
 
272 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  33.58 
 
 
273 aa  144  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  31.18 
 
 
276 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  32.95 
 
 
274 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  143  4e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  34.5 
 
 
272 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  30.97 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  30.42 
 
 
276 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  32.57 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  32.57 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  31.94 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  31.06 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  32.2 
 
 
269 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  33.57 
 
 
276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  31.01 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  30.42 
 
 
290 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  30.42 
 
 
276 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1242  protein of unknown function DUF299  29.66 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  30.42 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  29.63 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  29.55 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  30.77 
 
 
300 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  32.32 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  30.15 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  29.78 
 
 
292 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  31.06 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  29.26 
 
 
277 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  31.44 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  28.96 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  31.94 
 
 
327 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  31.46 
 
 
277 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  29.66 
 
 
280 aa  123  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  28.57 
 
 
279 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  28.63 
 
 
279 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  32.09 
 
 
296 aa  122  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  29.71 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  27.8 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  30.3 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  30.3 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  28.95 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  31.5 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  32.22 
 
 
291 aa  113  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  29.91 
 
 
270 aa  107  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1865  hypothetical protein  28.46 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0336096  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1434  hypothetical protein  29.7 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.855311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  27.6 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1905  hypothetical protein  29.14 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2036  hypothetical protein  29.14 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613437  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2173  hypothetical protein  29.49 
 
 
292 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0501659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01661  hypothetical protein  31.36 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.311887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1928  hypothetical protein  31.36 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.868856  normal  0.230597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1273  hypothetical protein  28.78 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1825  hypothetical protein  31.39 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1997  hypothetical protein  31.39 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.140597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>