208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2027 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  100 
 
 
282 aa  568  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  57.45 
 
 
292 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  47.27 
 
 
280 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  49.29 
 
 
275 aa  241  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  45.79 
 
 
279 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  45.42 
 
 
279 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  46.18 
 
 
274 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  45.85 
 
 
279 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  46.38 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  46.15 
 
 
279 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  47.19 
 
 
276 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  45.22 
 
 
276 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  45.49 
 
 
279 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  45.22 
 
 
276 aa  235  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  45.22 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  47.19 
 
 
273 aa  232  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  43.66 
 
 
270 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  45.28 
 
 
284 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  44.69 
 
 
279 aa  229  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  45.02 
 
 
279 aa  229  6e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  46.42 
 
 
272 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  41.82 
 
 
274 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  45.85 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  45.69 
 
 
273 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  47.43 
 
 
279 aa  221  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  42.7 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  47.43 
 
 
342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  46.04 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  46.55 
 
 
283 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  45.66 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  43.82 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  43.66 
 
 
276 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  46.42 
 
 
276 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  47.49 
 
 
276 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  38.81 
 
 
269 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  38.49 
 
 
269 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  35.66 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  32.86 
 
 
276 aa  176  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  35.34 
 
 
277 aa  175  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  33.94 
 
 
273 aa  175  9e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  37.5 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  37.5 
 
 
270 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  38.2 
 
 
270 aa  170  3e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  36.19 
 
 
269 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  37.5 
 
 
269 aa  165  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  34.59 
 
 
294 aa  165  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  31.65 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  35.51 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  38.11 
 
 
268 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  35.77 
 
 
269 aa  163  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  33.96 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  31.18 
 
 
270 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  32.71 
 
 
269 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  31.2 
 
 
266 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  32.35 
 
 
273 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  33.46 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  30.71 
 
 
278 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  31.39 
 
 
276 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  35.21 
 
 
278 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  28.94 
 
 
270 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  31.32 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  29.74 
 
 
272 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  29.74 
 
 
272 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  30.94 
 
 
266 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  28.52 
 
 
272 aa  143  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  35.93 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  33.33 
 
 
267 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  31.25 
 
 
270 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  30.83 
 
 
286 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  31.52 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1242  protein of unknown function DUF299  29.59 
 
 
271 aa  132  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  36.77 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  29.63 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  25.83 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  28.9 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  35.07 
 
 
296 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0622  hypothetical protein  35.19 
 
 
270 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  30.77 
 
 
307 aa  122  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2204  hypothetical protein  35.04 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000499041  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2439  hypothetical protein  32.62 
 
 
271 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.0202709 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1698  hypothetical protein  32.62 
 
 
287 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  28.75 
 
 
411 aa  118  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  32.13 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2427  protein of unknown function DUF299  33.57 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5313  hypothetical protein  31.43 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0599307  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  31.43 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  32.16 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2656  hypothetical protein  34.51 
 
 
314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000624696  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  32.16 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>