209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0450 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  79.55 
 
 
269 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  68.7 
 
 
269 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  68.82 
 
 
270 aa  380  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  68.82 
 
 
270 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  59.47 
 
 
280 aa  337  9e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  61.51 
 
 
269 aa  322  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  55.77 
 
 
268 aa  308  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  46.48 
 
 
267 aa  242  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  43.82 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  43.87 
 
 
273 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  43.63 
 
 
274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  43.02 
 
 
277 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  40.77 
 
 
288 aa  218  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  41.09 
 
 
286 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  43.77 
 
 
276 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  41.47 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  43.24 
 
 
270 aa  215  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  43.63 
 
 
266 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  40.08 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  42.25 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  42.31 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  40.08 
 
 
284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  40.53 
 
 
266 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  42.31 
 
 
272 aa  208  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  42.31 
 
 
272 aa  208  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  41.31 
 
 
280 aa  208  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  41.29 
 
 
290 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  41.29 
 
 
276 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  42.75 
 
 
266 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  41.29 
 
 
276 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  42.75 
 
 
294 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  39.77 
 
 
270 aa  205  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  42.64 
 
 
269 aa  204  8e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  39.16 
 
 
300 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  40.53 
 
 
276 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  42.11 
 
 
270 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  40.91 
 
 
273 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  41.42 
 
 
270 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  38.81 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  40.46 
 
 
272 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  38.7 
 
 
279 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  41.89 
 
 
276 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  37.84 
 
 
273 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  38.02 
 
 
274 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  38.78 
 
 
279 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  37.93 
 
 
273 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  38.4 
 
 
279 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  38.17 
 
 
276 aa  191  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  38.02 
 
 
279 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  37.16 
 
 
276 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  41.42 
 
 
275 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  37.64 
 
 
279 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  37.64 
 
 
280 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  37.36 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  40.94 
 
 
276 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  37.31 
 
 
279 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  40.08 
 
 
279 aa  188  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  40.08 
 
 
342 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  42.64 
 
 
283 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  38.81 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  37.12 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  38.2 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  37.64 
 
 
280 aa  182  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  36.6 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  35.93 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  38.02 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  37.4 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  35.52 
 
 
276 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  41.04 
 
 
292 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  35.58 
 
 
270 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1242  protein of unknown function DUF299  33.46 
 
 
271 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  34.35 
 
 
272 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  38.52 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  35.32 
 
 
307 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  38.43 
 
 
327 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  37.78 
 
 
277 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  33.71 
 
 
276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  37.08 
 
 
296 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  35.47 
 
 
270 aa  150  1e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  33.44 
 
 
411 aa  139  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33216  predicted protein  30.16 
 
 
513 aa  132  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0330963  normal  0.247759 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2427  protein of unknown function DUF299  31.99 
 
 
274 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2204  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000499041  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2578  hypothetical protein  35.51 
 
 
271 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.3778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1698  hypothetical protein  35.84 
 
 
287 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2439  hypothetical protein  35.84 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.0202709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1322  hypothetical protein  35.84 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1498  hypothetical protein  32.97 
 
 
271 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1485  hypothetical protein  32.26 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1434  hypothetical protein  32.39 
 
 
275 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.855311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>