208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3478 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  75.37 
 
 
279 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  75.56 
 
 
342 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  75.1 
 
 
276 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  66.05 
 
 
273 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  65.68 
 
 
273 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  67.16 
 
 
273 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  68.03 
 
 
273 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  61.89 
 
 
284 aa  351  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  60.3 
 
 
279 aa  345  3e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  62.74 
 
 
276 aa  342  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  60.46 
 
 
276 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  60.08 
 
 
290 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  60.08 
 
 
276 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  60.23 
 
 
283 aa  324  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  57.79 
 
 
279 aa  323  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  57.41 
 
 
279 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  60.84 
 
 
276 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  56.65 
 
 
279 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  58.17 
 
 
280 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  57.79 
 
 
276 aa  318  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  57.2 
 
 
279 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  59.07 
 
 
277 aa  315  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  54.75 
 
 
279 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  57.63 
 
 
280 aa  309  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  55.89 
 
 
274 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  51.92 
 
 
279 aa  294  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  51.15 
 
 
280 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  50 
 
 
274 aa  274  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  50.76 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  48.33 
 
 
300 aa  268  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  46.42 
 
 
282 aa  235  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  48.33 
 
 
292 aa  235  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  41.83 
 
 
275 aa  211  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  35.71 
 
 
276 aa  209  4e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  36.36 
 
 
273 aa  204  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  40.46 
 
 
269 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  41.63 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  35.61 
 
 
273 aa  198  9e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  40.23 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  39.23 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  38.7 
 
 
270 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  38.31 
 
 
270 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  38.31 
 
 
273 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  39.3 
 
 
269 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  38.91 
 
 
268 aa  175  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  36.84 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  41.41 
 
 
267 aa  171  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  35.8 
 
 
277 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  35.91 
 
 
280 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  35.5 
 
 
288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  36.05 
 
 
294 aa  158  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  37.55 
 
 
269 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  32.82 
 
 
270 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  34.18 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  34.87 
 
 
277 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  32.55 
 
 
272 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  33.58 
 
 
266 aa  148  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  31.89 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  34.33 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  31.89 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  30.94 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  34.91 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  34.5 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  32.82 
 
 
278 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  31.8 
 
 
276 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  30.94 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  33.98 
 
 
266 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  37.69 
 
 
296 aa  142  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  31.5 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  31.5 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  31.18 
 
 
269 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  35.98 
 
 
277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49027  predicted protein  34.92 
 
 
411 aa  133  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  32.42 
 
 
266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  31.13 
 
 
270 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  31.13 
 
 
270 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  31.13 
 
 
270 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  31.13 
 
 
270 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  31.13 
 
 
270 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  31.13 
 
 
270 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  31.13 
 
 
270 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  31.13 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  31.13 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  31.52 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  30.74 
 
 
270 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  35.13 
 
 
273 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  34.34 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  31.46 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  29.78 
 
 
307 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  33.08 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  33.08 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2049  hypothetical protein  34.88 
 
 
273 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1242  protein of unknown function DUF299  28.52 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1758  hypothetical protein  32.33 
 
 
272 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.572502  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2427  protein of unknown function DUF299  32.09 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2063  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.557113  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2190  hypothetical protein  32.59 
 
 
273 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  32.22 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2834  hypothetical protein  33.09 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>