209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2834 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2834  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1520  hypothetical protein  77.66 
 
 		 272 aa  434  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3043  hypothetical protein  71.43 
 
 		 273 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  69.6 
 
 		 273 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2400  hypothetical protein  69.6 
 
 		 273 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.238521  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  68.63 
 
 		 276 aa  391  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1815  hypothetical protein  68.13 
 
 		 273 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  68.63 
 
 		 276 aa  391  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2049  hypothetical protein  67.03 
 
 		 273 aa  384  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2023  hypothetical protein  71 
 
 		 271 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0775457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6074  hypothetical protein  71 
 
 		 271 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1273  hypothetical protein  71 
 
 		 271 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2003  hypothetical protein  71 
 
 		 271 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1322  hypothetical protein  71.38 
 
 		 277 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1361  hypothetical protein  69.49 
 
 		 283 aa  380  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1297  hypothetical protein  69.4 
 
 		 283 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0133713  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5313  hypothetical protein  70.63 
 
 		 271 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0599307  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1905  hypothetical protein  70.63 
 
 		 271 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1698  hypothetical protein  69.89 
 
 		 287 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2036  hypothetical protein  70.63 
 
 		 271 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2439  hypothetical protein  69.89 
 
 		 271 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.0202709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1420  hypothetical protein  67.78 
 
 		 279 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.0263307 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1539  hypothetical protein  69.89 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000339618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2566  hypothetical protein  69.89 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2190  hypothetical protein  64.84 
 
 		 273 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2039  hypothetical protein  69.89 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000106552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3272  hypothetical protein  69.89 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000389309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2420  hypothetical protein  69.89 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000632671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2476  hypothetical protein  69.89 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00018837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1311  hypothetical protein  69.89 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000394602  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2043  hypothetical protein  69.52 
 
 		 271 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000286207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1865  hypothetical protein  67.04 
 
 		 301 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0336096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1452  hypothetical protein  67.42 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000190114  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  62.73 
 
 		 273 aa  355  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1434  hypothetical protein  62.83 
 
 		 275 aa  350  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.855311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2656  hypothetical protein  63 
 
 		 314 aa  321  7e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000624696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1758  hypothetical protein  57.2 
 
 		 272 aa  314  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.572502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41680  hypothetical protein  52.87 
 
 		 274 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3538  hypothetical protein  52.87 
 
 		 272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23260  hypothetical protein  52.11 
 
 		 272 aa  285  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183047  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2204  hypothetical protein  53.87 
 
 		 270 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1769  hypothetical protein  51.34 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2084  hypothetical protein  50.57 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00711246  normal  0.0225535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2089  hypothetical protein  50.19 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1599  hypothetical protein  50.96 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.852515  hitchhiker  0.0000000322533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1592  hypothetical protein  50.57 
 
 		 272 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252196  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1498  hypothetical protein  50.38 
 
 		 271 aa  269  5e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3659  hypothetical protein  50.57 
 
 		 272 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717061  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2291  hypothetical protein  50.19 
 
 		 272 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2081  hypothetical protein  50.57 
 
 		 272 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1485  hypothetical protein  50.38 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1884  hypothetical protein  50.96 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0997  hypothetical protein  50.18 
 
 		 282 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.292387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1889  hypothetical protein  47.78 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.213154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0999  protein of unknown function DUF299  49.25 
 
 		 273 aa  261  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0219  hypothetical protein  49.23 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2421  hypothetical protein  49.45 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170649 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0594  hypothetical protein  51.14 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.201513  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2063  hypothetical protein  47.55 
 
 		 277 aa  244  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.557113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1743  hypothetical protein  49.04 
 
 		 270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0549  hypothetical protein  50.76 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.10493  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1736  hypothetical protein  46.95 
 
 		 273 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1842  hypothetical protein  46.95 
 
 		 273 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2578  hypothetical protein  47.53 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.3778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2759  hypothetical protein  45.22 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1656  hypothetical protein  44.85 
 
 		 273 aa  238  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02383  hypothetical protein  49.04 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1688  hypothetical protein  45.22 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00923  hypothetical protein  48.33 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1744  hypothetical protein  44.32 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59069  normal  0.0126649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2457  hypothetical protein  45.22 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2645  hypothetical protein  46.51 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2716  hypothetical protein  45.38 
 
 		 270 aa  235  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00410652  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2244  hypothetical protein  46.51 
 
 		 270 aa  235  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.277216  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2550  hypothetical protein  44.07 
 
 		 270 aa  234  8e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201421  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01672  hypothetical protein  44.69 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1939  protein of unknown function DUF299  44.69 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1928  hypothetical protein  44.69 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.868856  normal  0.230597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1487  hypothetical protein  44.69 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.88593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2173  hypothetical protein  45.04 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0501659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01661  hypothetical protein  44.69 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.311887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1783  hypothetical protein  44.69 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2421  hypothetical protein  44.69 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1870  hypothetical protein  46.15 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142601  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1921  hypothetical protein  44.69 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1862  hypothetical protein  45.74 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0232488  hitchhiker  0.0000000237766 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1334  hypothetical protein  46.18 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2602  hypothetical protein  45.74 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00819794  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2010  hypothetical protein  46.51 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1035  hypothetical protein  46.18 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0046897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1591  hypothetical protein  46.12 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00125366  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1666  hypothetical protein  46.12 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00389139  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2482  hypothetical protein  45.74 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363282  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1735  hypothetical protein  46.12 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0066836  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2073  hypothetical protein  45.77 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2489  hypothetical protein  45.74 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.230997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1459  hypothetical protein  44.89 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1825  hypothetical protein  44.89 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1997  hypothetical protein  44.89 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.140597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1443  hypothetical protein  44.89 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.222292  normal  0.0952573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>