52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3611 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  55.5 
 
 
630 aa  687    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3611  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
649 aa  1321    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4034  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.35 
 
 
533 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.938512 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  39.56 
 
 
781 aa  141  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2012  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  42.16 
 
 
328 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482457  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3410  hypothetical protein  32.75 
 
 
442 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.61808  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2693  hypothetical protein  32.75 
 
 
442 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  35.11 
 
 
654 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  37.27 
 
 
636 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  34.02 
 
 
670 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5184  hypothetical protein  33.33 
 
 
620 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0612  hypothetical protein  33.63 
 
 
713 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  31.67 
 
 
664 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4199  hypothetical protein  31.87 
 
 
684 aa  73.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  27.67 
 
 
903 aa  73.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2029  hypothetical protein  30.2 
 
 
636 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.939156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2004  hypothetical protein  30.2 
 
 
636 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1024  hypothetical protein  30.98 
 
 
703 aa  71.6  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 
1760 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 
900 aa  71.2  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2281  hypothetical protein  29.13 
 
 
723 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24262  normal  0.671539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  27 
 
 
898 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.92 
 
 
464 aa  64.3  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 
890 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4428  serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 
590 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0138643  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.6 
 
 
1686 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
871 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.5 
 
 
658 aa  58.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  27.19 
 
 
442 aa  57.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3377  hypothetical protein  28.18 
 
 
581 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 
830 aa  55.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.29 
 
 
729 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.9 
 
 
428 aa  54.7  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  32.62 
 
 
482 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.07 
 
 
313 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.11 
 
 
1711 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.92 
 
 
324 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  27.31 
 
 
1619 aa  52.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1592  Serine/threonine protein kinase  26.63 
 
 
572 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.58 
 
 
590 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1479  hypothetical protein  28.77 
 
 
617 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  25.51 
 
 
1097 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 
1687 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 
278 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.6 
 
 
795 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.6 
 
 
795 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  25.79 
 
 
731 aa  47.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4592  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
598 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398958  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  31.11 
 
 
463 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1553  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
760 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.1 
 
 
717 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0661  hypothetical protein  36.21 
 
 
534 aa  43.9  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.473612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>