29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4034 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4034  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 533 aa  1073    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.938512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2693  hypothetical protein  35.67 
 
 		 442 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3410  hypothetical protein  35.45 
 
 		 442 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.61808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3611  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.35 
 
 		 649 aa  157  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2012  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  44.12 
 
 		 328 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482457  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.54 
 
 		 630 aa  138  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  28.88 
 
 		 781 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  29.79 
 
 		 636 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2281  hypothetical protein  29.5 
 
 		 723 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24262  normal  0.671539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5184  hypothetical protein  28.86 
 
 		 620 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  26.7 
 
 		 654 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  27.32 
 
 		 664 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  29.22 
 
 		 670 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  25.29 
 
 		 903 aa  57.4  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  25.94 
 
 		 900 aa  57.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4199  hypothetical protein  26.4 
 
 		 684 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1024  hypothetical protein  25.89 
 
 		 703 aa  57  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  22.77 
 
 		 890 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 898 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.89 
 
 		 464 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2004  hypothetical protein  25.93 
 
 		 636 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2029  hypothetical protein  25.93 
 
 		 636 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.939156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4428  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 590 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0138643  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1553  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 760 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.84 
 
 		 658 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0612  hypothetical protein  23.26 
 
 		 713 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1479  hypothetical protein  25.57 
 
 		 617 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  23.04 
 
 		 576 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.5 
 
 		 428 aa  43.9  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>