22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2693 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3410  hypothetical protein  99.77 
 
 
442 aa  899    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.61808  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2693  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  902    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4034  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.67 
 
 
533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.938512 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.83 
 
 
630 aa  141  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3611  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 
649 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  26.94 
 
 
781 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  26.64 
 
 
636 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  27.27 
 
 
670 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2012  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  41.94 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482457  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  25.73 
 
 
664 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4199  hypothetical protein  29.71 
 
 
684 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.18 
 
 
485 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  24.66 
 
 
499 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  23.49 
 
 
654 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5184  hypothetical protein  28.26 
 
 
620 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0612  hypothetical protein  24.44 
 
 
713 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  30.3 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2004  hypothetical protein  34.94 
 
 
636 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2029  hypothetical protein  34.94 
 
 
636 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.939156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  30.58 
 
 
442 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1024  hypothetical protein  28.33 
 
 
703 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1479  hypothetical protein  27.98 
 
 
617 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>