16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2012 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2012  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  100 
 
 
328 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482457  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4034  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.12 
 
 
533 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.938512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3611  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.56 
 
 
649 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.7 
 
 
630 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2693  hypothetical protein  41.94 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3410  hypothetical protein  41.94 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.61808  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2004  hypothetical protein  30.58 
 
 
636 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2029  hypothetical protein  30.58 
 
 
636 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.939156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5184  hypothetical protein  29.67 
 
 
620 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4199  hypothetical protein  28.36 
 
 
684 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2281  hypothetical protein  28.5 
 
 
723 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24262  normal  0.671539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3377  hypothetical protein  29.91 
 
 
581 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1024  hypothetical protein  27.36 
 
 
703 aa  62.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4428  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
590 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0138643  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0612  hypothetical protein  31.94 
 
 
713 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0661  hypothetical protein  37.93 
 
 
534 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.473612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>