13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0661 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0661  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1035    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.473612  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5184  hypothetical protein  31.07 
 
 
620 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124969 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2004  hypothetical protein  32.71 
 
 
636 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2029  hypothetical protein  32.71 
 
 
636 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.939156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1024  hypothetical protein  30.31 
 
 
703 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4199  hypothetical protein  31.46 
 
 
684 aa  209  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2281  hypothetical protein  27.02 
 
 
723 aa  179  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24262  normal  0.671539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3377  hypothetical protein  30.86 
 
 
581 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0612  hypothetical protein  25.66 
 
 
713 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1479  hypothetical protein  28.27 
 
 
617 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1553  serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 
760 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3611  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.1 
 
 
649 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2012  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  37.93 
 
 
328 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482457  normal  0.300085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>