More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1651 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 
327 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  81.96 
 
 
326 aa  556  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  60.56 
 
 
349 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  55.59 
 
 
354 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  57.73 
 
 
325 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  51.7 
 
 
356 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  51.7 
 
 
356 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  46.5 
 
 
344 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  35.33 
 
 
322 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  32.08 
 
 
327 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.63 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.26 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  30.52 
 
 
336 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  26.32 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  28.25 
 
 
339 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  25.5 
 
 
342 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  27.46 
 
 
371 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  28.75 
 
 
367 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  26.26 
 
 
325 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  24.48 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.99 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  26.21 
 
 
304 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  27.27 
 
 
364 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  27.25 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  25.52 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  24.84 
 
 
362 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  25.08 
 
 
360 aa  89.7  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.9 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 
368 aa  89  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  25.39 
 
 
372 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  25.84 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  25.42 
 
 
386 aa  84  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.61 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.37 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2950  hypothetical protein  27.6 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  25.9 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.85 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.7 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2265  putative glycine cleavage T protein (aminomethyltransferase)  29.3 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  26.44 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.08 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.7 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.7 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.7 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.7 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.39 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.7 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.7 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  26.95 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.7 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.61 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.74 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.06 
 
 
363 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.39 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  26.22 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2956  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.74 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.07 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
799 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.55 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  28.51 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.61 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  25.45 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
815 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5195  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.5 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24971  aminomethyltransferase GcvT-like protein  24.82 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.31 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.96 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0861  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1895  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.3 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  26.25 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.3 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  23.53 
 
 
389 aa  72.4  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  23.26 
 
 
370 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  22.97 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.27 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1937  folate-binding protein YgfZ  26.45 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.68 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  25.68 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  25.68 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  25.84 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  22.6 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  41.35 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.69 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  21.47 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3305  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.27 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1918  folate-binding protein YgfZ  25.47 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.208988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  27.51 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.74 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.54 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.12 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1379  folate-binding protein YgfZ  25.63 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1804  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.63 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173465  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.55 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1832  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.43 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0630  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.32 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.31258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  31.45 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  26.95 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  24.39 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  25.48 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.76 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.0659803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>