267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0507 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  81.82 
 
 		 175 aa  295  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  63.64 
 
 		 176 aa  237  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  60.23 
 
 		 176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  60.23 
 
 		 176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  64.41 
 
 		 174 aa  217  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  64.74 
 
 		 172 aa  205  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  38.67 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  30.67 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  27.74 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  33.33 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  34.38 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  33.33 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  31.17 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  32.19 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  34.58 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  30.43 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  35.34 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  35.34 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  35.34 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1768  CheW protein  31.3 
 
 		 514 aa  57.8  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  33.08 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  30.88 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  32.28 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  27.82 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  35.34 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  29.69 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30.83 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  33.9 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  31.67 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  31.68 
 
 		 568 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  33.93 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  30.09 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  31.67 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  23.94 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  26.5 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  31.62 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  31.62 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.45 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  29.2 
 
 		 299 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  32.71 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  27.27 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  30.6 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  26.9 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  34.12 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  31.48 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  26.24 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  26.24 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  26.24 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  26.24 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  29.29 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  40.7 
 
 		 479 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  27.06 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0932  putative CheW protein  30.39 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.432309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  25.9 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  28.48 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  34.26 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.23 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.53 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  29.2 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  27.03 
 
 		 444 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  26.62 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  29.23 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  28.83 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  29.11 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  28.7 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4744  CheW protein  34.27 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001523 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  27.94 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  34.48 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  29.81 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  26.81 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  26.81 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  26.81 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  31.2 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25.71 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  29.55 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.53 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  29.25 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  32.73 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  27.03 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  25.71 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  25.53 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  25.53 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  25.53 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  32.63 
 
 		 779 aa  48.5  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  25.53 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  29.21 
 
 		 528 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  25.53 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  29.13 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  29.91 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  28.93 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  29.46 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  29.46 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  27.74 
 
 		 299 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  27.74 
 
 		 299 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.9 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  34.48 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  25.9 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  25.84 
 
 		 182 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.09 
 
 		 174 aa  48.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>